Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATP6AP1Q15904 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATP6AP1Q15904 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP6AP1Q15904 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP6AP1Q15904 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP6AP1Q15904 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATP6AP1Q15904 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP6AP1Q15904 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP6AP1Q15904 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATP6AP1Q15904 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP6AP1Q15904 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATP6AP1Q15904 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATP6AP1Q15904 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATP6AP1Q15904 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP6AP1Q15904 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATP6AP1Q15904 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP6AP1Q15904 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP6AP1Q15904 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATP6AP1Q15904 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP6AP1Q15904 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP6AP1Q15904 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP6AP1Q15904 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP6AP1Q15904 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATP6AP1Q15904 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATP6AP1Q15904 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATP6AP1Q15904 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP6AP1Q15904 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP6AP1Q15904 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP6AP1Q15904 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP6AP1Q15904 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP6AP1Q15904 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP6AP1Q15904 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP6AP1Q15904 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP6AP1Q15904 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6AP1Q15904 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6AP1Q15904 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6AP1Q15904 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6AP1Q15904 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP6AP1Q15904 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP6AP1Q15904 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP6AP1Q15904 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP6AP1Q15904 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6AP1Q15904 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6AP1Q15904 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP6AP1Q15904 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP6AP1Q15904 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP6AP1Q15904 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP6AP1Q15904 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP6AP1Q15904 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP6AP1Q15904 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATP6AP1Q15904 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP6AP1Q15904 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP6AP1Q15904 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP6AP1Q15904 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP6AP1Q15904 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP6AP1Q15904 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP6AP1Q15904 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP6AP1Q15904 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP6AP1Q15904 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP6AP1Q15904 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6AP1Q15904 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP6AP1Q15904 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP6AP1Q15904 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP6AP1Q15904 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP6AP1Q15904 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP6AP1Q15904 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP6AP1Q15904 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6AP1Q15904 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6AP1Q15904 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP6AP1Q15904 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP6AP1Q15904 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP6AP1Q15904 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP6AP1Q15904 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP6AP1Q15904 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP6AP1Q15904 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP6AP1Q15904 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP6AP1Q15904 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP6AP1Q15904 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP6AP1Q15904 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
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