Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 DBF4B-205ENST00000526924 2998 ntTSL 1 (best)11.82□□□□□ -0.523e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 PI4KB-204ENST00000368875 3983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.523e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 DBF4B-201ENST00000315005 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.873e-10■■■■■ 58.2
PCBP1Q15365 SLCO5A1-204ENST00000526750 2650 ntTSL 520.82■□□□□ 0.923e-9■■■■■ 57.7
PCBP1Q15365 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 57.7
PCBP1Q15365 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.073e-9■■■■■ 57.7
PCBP1Q15365 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.063e-9■■■■■ 57.7
PCBP1Q15365 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.741e-6■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.961e-6■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 NAPA-205ENST00000594001 1417 ntTSL 218.76■□□□□ 0.591e-6■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 NAPA-217ENST00000597778 3898 ntTSL 211.03□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 CKB-206ENST00000553994 746 ntTSL 232.52■■■□□ 2.82e-8■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 CKB-205ENST00000553878 856 ntTSL 232.52■■■□□ 2.82e-8■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 CKB-214ENST00000555770 816 ntTSL 429.33■■■□□ 2.292e-8■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 CKB-208ENST00000554426 775 ntTSL 529.24■■■□□ 2.272e-8■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.962e-8■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.462e-8■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 CKB-209ENST00000554705 803 ntTSL 221.38■■□□□ 1.012e-8■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.018e-16■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 CKB-213ENST00000555659 755 ntTSL 220.93■□□□□ 0.942e-8■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 NCLN-207ENST00000592235 380 ntTSL 518.91■□□□□ 0.628e-16■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 CKB-216ENST00000557530 523 ntTSL 414.77□□□□□ -0.052e-8■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 CCNK-204ENST00000555049 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.712e-8■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 CCNK-203ENST00000553865 5627 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.922e-8■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 CCNK-201ENST00000389879 3524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.962e-8■■■■■ 57.1
PCBP1Q15365 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.534e-8■■■■■ 56.8
PCBP1Q15365 SLC29A4-205ENST00000439491 805 ntTSL 316.74■□□□□ 0.274e-8■■■■■ 56.8
PCBP1Q15365 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.064e-8■■■■■ 56.8
PCBP1Q15365 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.094e-8■■■■■ 56.8
PCBP1Q15365 FAM189B-203ENST00000368366 1962 ntTSL 1 (best)24.04■■□□□ 1.446e-11■■■■■ 56.4
PCBP1Q15365 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.436e-11■■■■■ 56.4
PCBP1Q15365 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.136e-11■■■■■ 56.4
PCBP1Q15365 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.986e-11■■■■■ 56.4
PCBP1Q15365 FAM189B-209ENST00000497941 871 ntTSL 220.59■□□□□ 0.896e-11■■■■■ 56.4
PCBP1Q15365 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.676e-11■■■■■ 56.4
PCBP1Q15365 FAM189B-208ENST00000491082 1006 ntTSL 515.48■□□□□ 0.076e-11■■■■■ 56.4
PCBP1Q15365 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.346e-11■■■■■ 56.4
PCBP1Q15365 DYNLRB1-204ENST00000480759 1053 ntTSL 311.82□□□□□ -0.526e-11■■■■■ 56.4
PCBP1Q15365 FAM120B-201ENST00000476287 5155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.96e-11■■■■■ 56.4
PCBP1Q15365 DYNLRB1-202ENST00000357156 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.026e-11■■■■■ 56.4
PCBP1Q15365 FAM120B-203ENST00000537664 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.116e-11■■■■■ 56.4
PCBP1Q15365 ZNF276-209ENST00000568295 2206 ntTSL 226.97■■□□□ 1.918e-16■■■■■ 56
PCBP1Q15365 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.68e-16■■■■■ 56
PCBP1Q15365 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.144e-10■■■■■ 56
PCBP1Q15365 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.948e-16■■■■■ 56
PCBP1Q15365 ZNF276-203ENST00000561536 1947 ntTSL 220.07■□□□□ 0.88e-16■■■■■ 56
PCBP1Q15365 ZNF276-210ENST00000569426 436 ntTSL 318.13■□□□□ 0.498e-16■■■■■ 56
PCBP1Q15365 ZNF276-204ENST00000562530 1826 ntTSL 217.37■□□□□ 0.378e-16■■■■■ 56
PCBP1Q15365 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.128e-16■■■■■ 56
PCBP1Q15365 ZNF276-205ENST00000563541 588 ntTSL 315.66■□□□□ 0.18e-16■■■■■ 56
PCBP1Q15365 ZNF276-207ENST00000564004 2845 ntTSL 212.34□□□□□ -0.438e-16■■■■■ 56
PCBP1Q15365 ZNF276-206ENST00000563983 3403 ntTSL 211.67□□□□□ -0.548e-16■■■■■ 56
PCBP1Q15365 SLC9A3R1-204ENST00000581356 519 ntTSL 314.06□□□□□ -0.162e-9■■■■■ 55.6
PCBP1Q15365 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.115e-9■■■■■ 55.3
PCBP1Q15365 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.177e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-204ENST00000392219 872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.547e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-205ENST00000423817 892 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.587e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-210ENST00000588699 927 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.697e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-211ENST00000590686 862 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.77e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-202ENST00000392217 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.727e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-212ENST00000591716 682 ntTSL 310.47□□□□□ -0.737e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-209ENST00000586925 429 ntTSL 310.47□□□□□ -0.737e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-207ENST00000541435 898 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.037e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 FXYD5-213ENST00000592290 883 ntTSL 38.31□□□□□ -1.087e-75■■■■■ 55.2
PCBP1Q15365 CMIP-202ENST00000537098 4357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.24e-9■■■■■ 55
PCBP1Q15365 CMIP-203ENST00000539778 3937 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.414e-9■■■■■ 55
PCBP1Q15365 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.031e-7■■■■■ 54.9
PCBP1Q15365 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 54.9
PCBP1Q15365 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.491e-7■■■■■ 54.9
PCBP1Q15365 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.011e-7■■■■■ 54.9
PCBP1Q15365 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.151e-7■■■■■ 54.9
PCBP1Q15365 PMF1-BGLAP-201ENST00000320139 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.231e-7■■■■■ 54.9
PCBP1Q15365 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.041e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.951e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 PROCA1-208ENST00000579650 1007 ntTSL 1 (best)25.18■■□□□ 1.621e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.711e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 PROCA1-207ENST00000578097 527 ntTSL 417.81■□□□□ 0.441e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 PROCA1-205ENST00000473751 848 ntTSL 317.43■□□□□ 0.381e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.351e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 BANF1-203ENST00000524628 612 ntTSL 216.85■□□□□ 0.291e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.171e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.161e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.021e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 PROCA1-203ENST00000422880 565 ntTSL 413.86□□□□□ -0.191e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 PROCA1-204ENST00000439862 1137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.481e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 PROCA1-209ENST00000581289 766 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.661e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 BANF1-206ENST00000528648 362 ntTSL 39.83□□□□□ -0.841e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.481e-9■■■■■ 54.6
PCBP1Q15365 KRTCAP2-206ENST00000487350 785 ntTSL 1 (best)24.04■■□□□ 1.445e-9■■■■■ 54.3
PCBP1Q15365 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.625e-9■■■■■ 54.3
PCBP1Q15365 KRTCAP2-205ENST00000482246 414 ntTSL 317.44■□□□□ 0.385e-9■■■■■ 54.3
PCBP1Q15365 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.055e-9■■■■■ 54.3
PCBP1Q15365 KRTCAP2-204ENST00000471891 578 ntTSL 313.79□□□□□ -0.25e-9■■■■■ 54.3
PCBP1Q15365 KRTCAP2-210ENST00000497317 477 ntTSL 313.01□□□□□ -0.335e-9■■■■■ 54.3
PCBP1Q15365 KRTCAP2-209ENST00000492892 430 ntTSL 312.85□□□□□ -0.355e-9■■■■■ 54.3
PCBP1Q15365 KRTCAP2-208ENST00000491084 598 ntTSL 311.99□□□□□ -0.495e-9■■■■■ 54.3
PCBP1Q15365 KRTCAP2-207ENST00000490672 3264 ntTSL 211.61□□□□□ -0.555e-9■■■■■ 54.3
PCBP1Q15365 KRTCAP2-202ENST00000461136 271 ntTSL 34.76□□□□□ -1.655e-9■■■■■ 54.3
PCBP1Q15365 KRTCAP2-203ENST00000463527 463 ntTSL 34.76□□□□□ -1.655e-9■■■■■ 54.3
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