Protein–RNA interactions for Protein: Q12454

OCA6, Putative tyrosine-protein phosphatase OCA6, yeastyeast

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
OCA6Q12454 XYL2YLR070C 1071 nt10.3□□□□□ -0.76
OCA6Q12454 NBP35YGL091C 987 nt10.29□□□□□ -0.76
OCA6Q12454 SFA1YDL168W 1161 nt10.26□□□□□ -0.77
OCA6Q12454 SHH4YLR164W 507 nt10.26□□□□□ -0.77
OCA6Q12454 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.24□□□□□ -0.77
OCA6Q12454 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.24□□□□□ -0.77
OCA6Q12454 SPT20YOL148C 1815 nt10.23□□□□□ -0.77
OCA6Q12454 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt10.21□□□□□ -0.77
OCA6Q12454 COQ2YNR041C 1119 nt10.2□□□□□ -0.78
OCA6Q12454 RBG1YAL036C 1110 nt10.19□□□□□ -0.78
OCA6Q12454 HEL2YDR266C 1920 nt10.19□□□□□ -0.78
OCA6Q12454 YCR087WYCR087W 516 nt10.17□□□□□ -0.78
OCA6Q12454 TIR3YIL011W 810 nt10.17□□□□□ -0.78
OCA6Q12454 AIM45YPR004C 1035 nt10.17□□□□□ -0.78
OCA6Q12454 RPC82YPR190C 1965 nt10.15□□□□□ -0.78
OCA6Q12454 RTN2YDL204W 1182 nt10.14□□□□□ -0.79
OCA6Q12454 MRP20YDR405W 792 nt10.14□□□□□ -0.79
OCA6Q12454 PRO1YDR300C 1287 nt10.12□□□□□ -0.79
OCA6Q12454 TOM6YOR045W 186 nt10.12□□□□□ -0.79
OCA6Q12454 INA1YLR413W 2028 nt10.12□□□□□ -0.79
OCA6Q12454 POM34YLR018C 900 nt10.11□□□□□ -0.79
OCA6Q12454 YMR244WYMR244W 1068 nt10.09□□□□□ -0.79
OCA6Q12454 ARP6YLR085C 1317 nt10.08□□□□□ -0.8
OCA6Q12454 GLR1YPL091W 1452 nt10.07□□□□□ -0.8
OCA6Q12454 RIM8YGL045W 1629 nt10.07□□□□□ -0.8
OCA6Q12454 LSC2YGR244C 1284 nt10.06□□□□□ -0.8
OCA6Q12454 PEX2YJL210W 816 nt10.06□□□□□ -0.8
OCA6Q12454 PLB1YMR008C 1995 nt10.06□□□□□ -0.8
OCA6Q12454 HIF1YLL022C 1158 nt10.05□□□□□ -0.8
OCA6Q12454 HIP1YGR191W 1812 nt10.03□□□□□ -0.8
OCA6Q12454 ATG15YCR068W 1563 nt10.02□□□□□ -0.81
OCA6Q12454 RPL4BYDR012W 1089 nt10.02□□□□□ -0.81
OCA6Q12454 RPL4AYBR031W 1089 nt10.02□□□□□ -0.81
OCA6Q12454 RPS14BYJL191W 417 nt10□□□□□ -0.81
OCA6Q12454 YML089CYML089C 369 nt10□□□□□ -0.81
OCA6Q12454 GAP1YKR039W 1809 nt10□□□□□ -0.81
OCA6Q12454 TIF6YPR016C 738 nt9.99□□□□□ -0.81
OCA6Q12454 MUP1YGR055W 1725 nt9.99□□□□□ -0.81
OCA6Q12454 ALD4YOR374W 1560 nt9.97□□□□□ -0.81
OCA6Q12454 YGL114WYGL114W 2178 nt9.97□□□□□ -0.81
OCA6Q12454 CLB6YGR109C 1143 nt9.96□□□□□ -0.82
OCA6Q12454 PRM5YIL117C 957 nt9.96□□□□□ -0.82
OCA6Q12454 UTH1YKR042W 1098 nt9.96□□□□□ -0.82
OCA6Q12454 NRT1YOR071C 1797 nt9.93□□□□□ -0.82
OCA6Q12454 UTR1YJR049C 1593 nt9.92□□□□□ -0.82
OCA6Q12454 MET28YIR017C 564 nt9.9□□□□□ -0.82
OCA6Q12454 RBG2YGR173W 1107 nt9.89□□□□□ -0.83
OCA6Q12454 SDH5YOL071W 489 nt9.88□□□□□ -0.83
OCA6Q12454 HOL1YNR055C 1761 nt9.87□□□□□ -0.83
OCA6Q12454 CAB5YDR196C 726 nt9.86□□□□□ -0.83
OCA6Q12454 DIF1YLR437C 402 nt9.86□□□□□ -0.83
OCA6Q12454 MAE1YKL029C 2010 nt9.84□□□□□ -0.83
OCA6Q12454 TSC10YBR265W 963 nt9.83□□□□□ -0.84
OCA6Q12454 YGR012WYGR012W 1182 nt9.82□□□□□ -0.84
OCA6Q12454 YLR111WYLR111W 333 nt9.82□□□□□ -0.84
OCA6Q12454 YLR279WYLR279W 390 nt9.81□□□□□ -0.84
OCA6Q12454 YMR226CYMR226C 804 nt9.81□□□□□ -0.84
OCA6Q12454 ZTA1YBR046C 1005 nt9.8□□□□□ -0.84
OCA6Q12454 ZRT3YKL175W 1512 nt9.8□□□□□ -0.84
OCA6Q12454 MSB4YOL112W 1479 nt9.79□□□□□ -0.84
OCA6Q12454 RAD23YEL037C 1197 nt9.78□□□□□ -0.84
OCA6Q12454 YAR028WYAR028W 705 nt9.78□□□□□ -0.84
OCA6Q12454 FIT3YOR383C 615 nt9.77□□□□□ -0.85
OCA6Q12454 MTG2YHR168W 1557 nt9.76□□□□□ -0.85
OCA6Q12454 YJL067WYJL067W 351 nt9.75□□□□□ -0.85
OCA6Q12454 AKR2YOR034C 2250 nt9.74□□□□□ -0.85
OCA6Q12454 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.74□□□□□ -0.85
OCA6Q12454 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.71□□□□□ -0.86
OCA6Q12454 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.71□□□□□ -0.86
OCA6Q12454 SAM35YHR083W 990 nt9.71□□□□□ -0.86
OCA6Q12454 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.71□□□□□ -0.86
OCA6Q12454 YNL024CYNL024C 741 nt9.71□□□□□ -0.86
OCA6Q12454 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.71□□□□□ -0.86
OCA6Q12454 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.71□□□□□ -0.86
OCA6Q12454 ALP1YNL270C 1722 nt9.7□□□□□ -0.86
OCA6Q12454 RIB3YDR487C 627 nt9.7□□□□□ -0.86
OCA6Q12454 ACO2YJL200C 2370 nt9.68□□□□□ -0.86
OCA6Q12454 MET2YNL277W 1461 nt9.68□□□□□ -0.86
OCA6Q12454 YMR209CYMR209C 1374 nt9.67□□□□□ -0.86
OCA6Q12454 YOR325WYOR325W 474 nt9.67□□□□□ -0.86
OCA6Q12454 ILV3YJR016C 1758 nt9.67□□□□□ -0.86
OCA6Q12454 SED1YDR077W 1017 nt9.65□□□□□ -0.86
OCA6Q12454 DBP1YPL119C 1854 nt9.64□□□□□ -0.87
OCA6Q12454 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.63□□□□□ -0.87
OCA6Q12454 SFP1YLR403W 2052 nt9.62□□□□□ -0.87
OCA6Q12454 LIP1YMR298W 453 nt9.62□□□□□ -0.87
OCA6Q12454 HXT1YHR094C 1713 nt9.6□□□□□ -0.87
OCA6Q12454 YBL086CYBL086C 1401 nt9.6□□□□□ -0.87
OCA6Q12454 SAM1YLR180W 1149 nt9.6□□□□□ -0.87
OCA6Q12454 YPL251WYPL251W 303 nt9.59□□□□□ -0.87
OCA6Q12454 UGP1YKL035W 1500 nt9.59□□□□□ -0.87
OCA6Q12454 COQ8YGL119W 1506 nt9.58□□□□□ -0.88
OCA6Q12454 UGA4YDL210W 1716 nt9.58□□□□□ -0.88
OCA6Q12454 HIS2YFR025C 1008 nt9.57□□□□□ -0.88
OCA6Q12454 GND1YHR183W 1470 nt9.56□□□□□ -0.88
OCA6Q12454 YIL100C-AYIL100C-A 339 nt9.56□□□□□ -0.88
OCA6Q12454 LOT5YKL183W 921 nt9.56□□□□□ -0.88
OCA6Q12454 FCY21YER060W 1587 nt9.55□□□□□ -0.88
OCA6Q12454 SMM1YNR015W 1155 nt9.53□□□□□ -0.88
OCA6Q12454 SHY1YGR112W 1170 nt9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.1 ms