Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 COX3Q0275 810 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 SPT20YOL148C 1815 nt9.01□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 SUA5YGL169W 1281 nt9□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 RSC4YKR008W 1878 nt9□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 GAT1YFL021W 1533 nt9□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 RDN18-1RDN18-1 1800 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 RDN18-2RDN18-2 1800 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 KDX1YKL161C 1302 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 RPC82YPR190C 1965 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 EEB1YPL095C 1371 nt8.99□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 IMP2'YIL154C 1041 nt8.98□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 YJL211CYJL211C 444 nt8.98□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 YLR281CYLR281C 468 nt8.98□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 RNQ1YCL028W 1218 nt8.98□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 PCL10YGL134W 1302 nt8.98□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 YSP3YOR003W 1437 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 YFL067WYFL067W 528 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 NAS6YGR232W 687 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 DUS1YML080W 1272 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 TAF4YMR005W 1167 nt8.97□□□□□ -0.97
TY1A-DR3Q12441 NDJ1YOL104C 1059 nt8.96□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 MIC12YBR262C 321 nt8.96□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 SOR2YDL246C 1074 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 MRS3YJL133W 945 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 SOR1YJR159W 1074 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 TRM5YHR070W 1500 nt8.95□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 RIM8YGL045W 1629 nt8.94□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 YHL044WYHL044W 708 nt8.94□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 IDH1YNL037C 1083 nt8.94□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 Q0017Q0017 162 nt8.94□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 YLR311CYLR311C 348 nt8.93□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 YNL165WYNL165W 1221 nt8.93□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 AQY1YPR192W 918 nt8.93□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 ARP6YLR085C 1317 nt8.93□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 GAL1YBR020W 1587 nt8.92□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 CTR1YPR124W 1221 nt8.92□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 SIR2YDL042C 1689 nt8.91□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 ANP1YEL036C 1503 nt8.91□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 YDL157CYDL157C 357 nt8.91□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 RRP1YDR087C 837 nt8.91□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 STR3YGL184C 1398 nt8.9□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt8.9□□□□□ -0.98
TY1A-DR3Q12441 XDJ1YLR090W 1380 nt8.89□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 NEJ1YLR265C 1029 nt8.89□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 DIA1YMR316W 1011 nt8.89□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 AME1YBR211C 975 nt8.89□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt8.88□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 MMS21YEL019C 804 nt8.88□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 MRI1YPR118W 1236 nt8.88□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 DUT1YBR252W 444 nt8.88□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 RMA1YKL132C 1293 nt8.87□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 DDR2YOL052C-A 186 nt8.87□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 VPS28YPL065W 729 nt8.87□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 PEX34YCL056C 435 nt8.87□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 YGL114WYGL114W 2178 nt8.87□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 MUP1YGR055W 1725 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 PHO92YDR374C 921 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 GTT3YEL017W 1014 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 YMR074CYMR074C 438 nt8.86□□□□□ -0.99
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TY1A-DR3Q12441 RUF21RUF21 707 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 WHI5YOR083W 888 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 COA2YPL189C-A 207 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 MXR2YCL033C 507 nt8.86□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 BNA2YJR078W 1362 nt8.85□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 YPR1YDR368W 939 nt8.84□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 LPX1YOR084W 1164 nt8.84□□□□□ -0.99
TY1A-DR3Q12441 TSR2YLR435W 618 nt8.83□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 MAE1YKL029C 2010 nt8.83□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 HHO1YPL127C 777 nt8.82□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 LYS12YIL094C 1116 nt8.81□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 YJR056CYJR056C 711 nt8.81□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 PZF1YPR186C 1290 nt8.81□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 YNL040WYNL040W 1371 nt8.81□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 INA1YLR413W 2028 nt8.81□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 SFP1YLR403W 2052 nt8.81□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 YER147C-AYER147C-A 411 nt8.8□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 YOL037CYOL037C 354 nt8.8□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 YPR150WYPR150W 522 nt8.8□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 GPI16YHR188C 1833 nt8.8□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 GDH3YAL062W 1374 nt8.79□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 MIX17YMR002W 471 nt8.79□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 CWC25YNL245C 540 nt8.79□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 FAR3YMR052W 615 nt8.78□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 YCL042WYCL042W 360 nt8.78□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 ALG7YBR243C 1347 nt8.78□□□□□ -1
TY1A-DR3Q12441 YHR054CYHR054C 1065 nt8.77□□□□□ -1.01
TY1A-DR3Q12441 PEX12YMR026C 1200 nt8.77□□□□□ -1.01
TY1A-DR3Q12441 RPM1RPM1 483 nt8.77□□□□□ -1.01
TY1A-DR3Q12441 PRE2YPR103W 864 nt8.77□□□□□ -1.01
TY1A-DR3Q12441 FRD1YEL047C 1413 nt8.77□□□□□ -1.01
TY1A-DR3Q12441 HOL1YNR055C 1761 nt8.76□□□□□ -1.01
TY1A-DR3Q12441 YMR114CYMR114C 1107 nt8.75□□□□□ -1.01
TY1A-DR3Q12441 OCA1YNL099C 717 nt8.75□□□□□ -1.01
TY1A-DR3Q12441 FEN2YCR028C 1539 nt8.75□□□□□ -1.01
TY1A-DR3Q12441 HIF1YLL022C 1158 nt8.74□□□□□ -1.01
TY1A-DR3Q12441 DSE3YOR264W 1293 nt8.74□□□□□ -1.01
TY1A-DR3Q12441 YLR460CYLR460C 1131 nt8.73□□□□□ -1.01
TY1A-DR3Q12441 FMP45YDL222C 930 nt8.72□□□□□ -1.01
TY1A-DR3Q12441 DIC1YLR348C 897 nt8.72□□□□□ -1.01
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