Protein–RNA interactions for Protein: Q12239

YOL107W, Transmembrane protein 115 homolog, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YOL107WQ12239 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.6□□□□□ -0.87
YOL107WQ12239 NBP35YGL091C 987 nt9.59□□□□□ -0.87
YOL107WQ12239 AQY2YLL052C 450 nt9.59□□□□□ -0.87
YOL107WQ12239 SNF1YDR477W 1902 nt9.57□□□□□ -0.88
YOL107WQ12239 STR3YGL184C 1398 nt9.56□□□□□ -0.88
YOL107WQ12239 FRE6YLL051C 2139 nt9.55□□□□□ -0.88
YOL107WQ12239 YCL074WYCL074W 927 nt9.55□□□□□ -0.88
YOL107WQ12239 TIR3YIL011W 810 nt9.55□□□□□ -0.88
YOL107WQ12239 RBG2YGR173W 1107 nt9.54□□□□□ -0.88
YOL107WQ12239 SHH4YLR164W 507 nt9.53□□□□□ -0.88
YOL107WQ12239 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.52□□□□□ -0.89
YOL107WQ12239 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.52□□□□□ -0.89
YOL107WQ12239 RPL4BYDR012W 1089 nt9.52□□□□□ -0.89
YOL107WQ12239 YKR005CYKR005C 1578 nt9.52□□□□□ -0.89
YOL107WQ12239 RPL4AYBR031W 1089 nt9.52□□□□□ -0.89
YOL107WQ12239 HSL7YBR133C 2484 nt9.5□□□□□ -0.89
YOL107WQ12239 CLB6YGR109C 1143 nt9.49□□□□□ -0.89
YOL107WQ12239 YMR226CYMR226C 804 nt9.49□□□□□ -0.89
YOL107WQ12239 TOM6YOR045W 186 nt9.49□□□□□ -0.89
YOL107WQ12239 POM34YLR018C 900 nt9.45□□□□□ -0.9
YOL107WQ12239 LSC2YGR244C 1284 nt9.44□□□□□ -0.9
YOL107WQ12239 RPS14BYJL191W 417 nt9.44□□□□□ -0.9
YOL107WQ12239 PEX2YJL210W 816 nt9.44□□□□□ -0.9
YOL107WQ12239 UTH1YKR042W 1098 nt9.44□□□□□ -0.9
YOL107WQ12239 YLR111WYLR111W 333 nt9.44□□□□□ -0.9
YOL107WQ12239 SDH5YOL071W 489 nt9.44□□□□□ -0.9
YOL107WQ12239 PRO1YDR300C 1287 nt9.43□□□□□ -0.9
YOL107WQ12239 YML089CYML089C 369 nt9.43□□□□□ -0.9
YOL107WQ12239 HIP1YGR191W 1812 nt9.41□□□□□ -0.9
YOL107WQ12239 ATG15YCR068W 1563 nt9.4□□□□□ -0.9
YOL107WQ12239 IRC24YIR036C 792 nt9.39□□□□□ -0.91
YOL107WQ12239 YAT1YAR035W 2064 nt9.39□□□□□ -0.91
YOL107WQ12239 NRT1YOR071C 1797 nt9.39□□□□□ -0.91
YOL107WQ12239 ARP6YLR085C 1317 nt9.38□□□□□ -0.91
YOL107WQ12239 YGR259CYGR259C 441 nt9.38□□□□□ -0.91
YOL107WQ12239 HEL2YDR266C 1920 nt9.37□□□□□ -0.91
YOL107WQ12239 MET28YIR017C 564 nt9.36□□□□□ -0.91
YOL107WQ12239 RTN2YDL204W 1182 nt9.35□□□□□ -0.91
YOL107WQ12239 TIF6YPR016C 738 nt9.35□□□□□ -0.91
YOL107WQ12239 RAD23YEL037C 1197 nt9.34□□□□□ -0.91
YOL107WQ12239 TSC10YBR265W 963 nt9.34□□□□□ -0.91
YOL107WQ12239 GAP1YKR039W 1809 nt9.33□□□□□ -0.92
YOL107WQ12239 YGR012WYGR012W 1182 nt9.32□□□□□ -0.92
YOL107WQ12239 PLB1YMR008C 1995 nt9.3□□□□□ -0.92
YOL107WQ12239 SAM1YLR180W 1149 nt9.29□□□□□ -0.92
YOL107WQ12239 FIT3YOR383C 615 nt9.26□□□□□ -0.93
YOL107WQ12239 YLR279WYLR279W 390 nt9.25□□□□□ -0.93
YOL107WQ12239 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.25□□□□□ -0.93
YOL107WQ12239 SSN3YPL042C 1668 nt9.24□□□□□ -0.93
YOL107WQ12239 RIB3YDR487C 627 nt9.23□□□□□ -0.93
YOL107WQ12239 SPT20YOL148C 1815 nt9.23□□□□□ -0.93
YOL107WQ12239 CAB5YDR196C 726 nt9.22□□□□□ -0.93
YOL107WQ12239 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.21□□□□□ -0.94
YOL107WQ12239 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.21□□□□□ -0.94
YOL107WQ12239 MSB4YOL112W 1479 nt9.2□□□□□ -0.94
YOL107WQ12239 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt9.19□□□□□ -0.94
YOL107WQ12239 RIM8YGL045W 1629 nt9.19□□□□□ -0.94
YOL107WQ12239 UTR1YJR049C 1593 nt9.18□□□□□ -0.94
YOL107WQ12239 DIF1YLR437C 402 nt9.18□□□□□ -0.94
YOL107WQ12239 YAR028WYAR028W 705 nt9.16□□□□□ -0.94
YOL107WQ12239 ALP1YNL270C 1722 nt9.14□□□□□ -0.95
YOL107WQ12239 AKR2YOR034C 2250 nt9.12□□□□□ -0.95
YOL107WQ12239 ZTA1YBR046C 1005 nt9.11□□□□□ -0.95
YOL107WQ12239 MTG2YHR168W 1557 nt9.11□□□□□ -0.95
YOL107WQ12239 INA1YLR413W 2028 nt9.1□□□□□ -0.95
YOL107WQ12239 SAM35YHR083W 990 nt9.1□□□□□ -0.95
YOL107WQ12239 BSP1YPR171W 1731 nt9.08□□□□□ -0.96
YOL107WQ12239 RPC82YPR190C 1965 nt9.08□□□□□ -0.96
YOL107WQ12239 PRM5YIL117C 957 nt9.08□□□□□ -0.96
YOL107WQ12239 GND1YHR183W 1470 nt9.07□□□□□ -0.96
YOL107WQ12239 LOT5YKL183W 921 nt9.06□□□□□ -0.96
YOL107WQ12239 YPI1YFR003C 468 nt9.05□□□□□ -0.96
YOL107WQ12239 MET2YNL277W 1461 nt9.04□□□□□ -0.96
YOL107WQ12239 YJL195CYJL195C 702 nt9.04□□□□□ -0.96
YOL107WQ12239 ADH1YOL086C 1047 nt9.04□□□□□ -0.96
YOL107WQ12239 YGL114WYGL114W 2178 nt9.04□□□□□ -0.96
YOL107WQ12239 FUN14YAL008W 597 nt9.02□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 SED1YDR077W 1017 nt9.01□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.01□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 MUP1YGR055W 1725 nt9.01□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.01□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 MAE1YKL029C 2010 nt9.01□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.01□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.01□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 SMM1YNR015W 1155 nt9.01□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 STE4YOR212W 1272 nt9.01□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.01□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 APT2YDR441C 546 nt9□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 RAD51YER095W 1203 nt9□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 YNR029CYNR029C 1290 nt8.99□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 LIP1YMR298W 453 nt8.98□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 FCY21YER060W 1587 nt8.98□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 ALD4YOR374W 1560 nt8.96□□□□□ -0.97
YOL107WQ12239 YLR349WYLR349W 507 nt8.95□□□□□ -0.98
YOL107WQ12239 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.94□□□□□ -0.98
YOL107WQ12239 UGA4YDL210W 1716 nt8.92□□□□□ -0.98
YOL107WQ12239 HXT1YHR094C 1713 nt8.92□□□□□ -0.98
YOL107WQ12239 DBP1YPL119C 1854 nt8.91□□□□□ -0.98
YOL107WQ12239 ADH7YCR105W 1086 nt8.91□□□□□ -0.98
YOL107WQ12239 PRY1YJL079C 900 nt8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 157.5 ms