Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

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Length 1,170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 CUS2YNL286W 858 nt11.73□□□□□ -0.53
NCR1Q12200 YIR016WYIR016W 798 nt11.72□□□□□ -0.53
NCR1Q12200 UBC12YLR306W 567 nt11.72□□□□□ -0.53
NCR1Q12200 ARP6YLR085C 1317 nt11.71□□□□□ -0.53
NCR1Q12200 RUF21RUF21 707 nt11.71□□□□□ -0.53
NCR1Q12200 THP3YPR045C 1413 nt11.7□□□□□ -0.54
NCR1Q12200 SPT8YLR055C 1809 nt11.69□□□□□ -0.54
NCR1Q12200 COX3Q0275 810 nt11.68□□□□□ -0.54
NCR1Q12200 YML079WYML079W 606 nt11.67□□□□□ -0.54
NCR1Q12200 YNL040WYNL040W 1371 nt11.67□□□□□ -0.54
NCR1Q12200 NUF2YOL069W 1356 nt11.67□□□□□ -0.54
NCR1Q12200 CLB6YGR109C 1143 nt11.66□□□□□ -0.54
NCR1Q12200 YJL107CYJL107C 1164 nt11.66□□□□□ -0.54
NCR1Q12200 VPS28YPL065W 729 nt11.66□□□□□ -0.54
NCR1Q12200 MIR1YJR077C 936 nt11.65□□□□□ -0.54
NCR1Q12200 YPR1YDR368W 939 nt11.63□□□□□ -0.55
NCR1Q12200 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt11.63□□□□□ -0.55
NCR1Q12200 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt11.63□□□□□ -0.55
NCR1Q12200 VPS75YNL246W 795 nt11.63□□□□□ -0.55
NCR1Q12200 SKI6YGR195W 741 nt11.62□□□□□ -0.55
NCR1Q12200 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.62□□□□□ -0.55
NCR1Q12200 IDI1YPL117C 867 nt11.62□□□□□ -0.55
NCR1Q12200 YHM2YMR241W 945 nt11.61□□□□□ -0.55
NCR1Q12200 NAT4YMR069W 858 nt11.59□□□□□ -0.55
NCR1Q12200 YGR011WYGR011W 327 nt11.58□□□□□ -0.56
NCR1Q12200 TSR2YLR435W 618 nt11.57□□□□□ -0.56
NCR1Q12200 MIC12YBR262C 321 nt11.57□□□□□ -0.56
NCR1Q12200 MSF1YPR047W 1410 nt11.56□□□□□ -0.56
NCR1Q12200 MOD5YOR274W 1287 nt11.55□□□□□ -0.56
NCR1Q12200 THI74YDR438W 1113 nt11.54□□□□□ -0.56
NCR1Q12200 ZTA1YBR046C 1005 nt11.54□□□□□ -0.56
NCR1Q12200 SHM2YLR058C 1410 nt11.53□□□□□ -0.56
NCR1Q12200 YHR054CYHR054C 1065 nt11.53□□□□□ -0.56
NCR1Q12200 RSA3YLR221C 663 nt11.53□□□□□ -0.56
NCR1Q12200 GLK1YCL040W 1503 nt11.53□□□□□ -0.56
NCR1Q12200 MPC1YGL080W 393 nt11.52□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt11.51□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 RSM23YGL129C 1353 nt11.51□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 NIT1YIL164C 600 nt11.5□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 YJL118WYJL118W 660 nt11.5□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 DIA1YMR316W 1011 nt11.5□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 XDJ1YLR090W 1380 nt11.5□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt11.49□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 YOL150CYOL150C 312 nt11.49□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 TGS1YPL157W 948 nt11.49□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 TAZ1YPR140W 1146 nt11.49□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 RER1YCL001W 567 nt11.48□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 YFL054CYFL054C 1941 nt11.48□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 RAX1YOR301W 1308 nt11.47□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 TIM17YJL143W 477 nt11.47□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 ECM9YKR004C 1134 nt11.47□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 DAT1YML113W 747 nt11.47□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 MCT1YOR221C 1083 nt11.47□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 YDL157CYDL157C 357 nt11.46□□□□□ -0.57
NCR1Q12200 YLR311CYLR311C 348 nt11.45□□□□□ -0.58
NCR1Q12200 YHP1YDR451C 1062 nt11.44□□□□□ -0.58
NCR1Q12200 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt11.44□□□□□ -0.58
NCR1Q12200 YDR010CYDR010C 333 nt11.43□□□□□ -0.58
NCR1Q12200 BNA2YJR078W 1362 nt11.42□□□□□ -0.58
NCR1Q12200 BI2Q0110 1272 nt11.42□□□□□ -0.58
NCR1Q12200 SGT2YOR007C 1041 nt11.42□□□□□ -0.58
NCR1Q12200 SHB17YKR043C 816 nt11.41□□□□□ -0.58
NCR1Q12200 SUT2YPR009W 807 nt11.41□□□□□ -0.58
NCR1Q12200 GDH3YAL062W 1374 nt11.41□□□□□ -0.58
NCR1Q12200 UBA4YHR111W 1323 nt11.4□□□□□ -0.58
NCR1Q12200 YDL158CYDL158C 309 nt11.4□□□□□ -0.58
NCR1Q12200 UME6YDR207C 2511 nt11.4□□□□□ -0.59
NCR1Q12200 PRM4YPL156C 855 nt11.39□□□□□ -0.59
NCR1Q12200 MRPL36YBR122C 534 nt11.39□□□□□ -0.59
NCR1Q12200 YGL118CYGL118C 438 nt11.38□□□□□ -0.59
NCR1Q12200 SED5YLR026C 1023 nt11.38□□□□□ -0.59
NCR1Q12200 CSI1YMR025W 888 nt11.38□□□□□ -0.59
NCR1Q12200 AGP1YCL025C 1902 nt11.38□□□□□ -0.59
NCR1Q12200 YGL034CYGL034C 366 nt11.36□□□□□ -0.59
NCR1Q12200 PAU7YAR020C 168 nt11.36□□□□□ -0.59
NCR1Q12200 HHO1YPL127C 777 nt11.36□□□□□ -0.59
NCR1Q12200 PEX34YCL056C 435 nt11.36□□□□□ -0.59
NCR1Q12200 YGR201CYGR201C 678 nt11.35□□□□□ -0.59
NCR1Q12200 DUT1YBR252W 444 nt11.35□□□□□ -0.59
NCR1Q12200 SUT1YGL162W 900 nt11.34□□□□□ -0.59
NCR1Q12200 FIP1YJR093C 984 nt11.33□□□□□ -0.6
NCR1Q12200 MSA2YKR077W 1092 nt11.33□□□□□ -0.6
NCR1Q12200 RAD17YOR368W 1206 nt11.33□□□□□ -0.6
NCR1Q12200 CCA1YER168C 1641 nt11.33□□□□□ -0.6
NCR1Q12200 ERG12YMR208W 1332 nt11.32□□□□□ -0.6
NCR1Q12200 YLR283WYLR283W 945 nt11.31□□□□□ -0.6
NCR1Q12200 YMR144WYMR144W 1029 nt11.31□□□□□ -0.6
NCR1Q12200 YMR244WYMR244W 1068 nt11.31□□□□□ -0.6
NCR1Q12200 CBS1YDL069C 690 nt11.3□□□□□ -0.6
NCR1Q12200 PIC2YER053C 903 nt11.3□□□□□ -0.6
NCR1Q12200 YOL107WYOL107W 1029 nt11.3□□□□□ -0.6
NCR1Q12200 SWE1YJL187C 2460 nt11.3□□□□□ -0.6
NCR1Q12200 XYL2YLR070C 1071 nt11.29□□□□□ -0.6
NCR1Q12200 HMRA1YCR097W 381 nt11.28□□□□□ -0.6
NCR1Q12200 YSR3YKR053C 1215 nt11.28□□□□□ -0.6
NCR1Q12200 OSW1YOR255W 837 nt11.28□□□□□ -0.6
NCR1Q12200 SLX1YBR228W 915 nt11.27□□□□□ -0.61
NCR1Q12200 AVT6YER119C 1347 nt11.27□□□□□ -0.61
NCR1Q12200 RET2YFR051C 1641 nt11.26□□□□□ -0.61
NCR1Q12200 YGR168CYGR168C 1131 nt11.25□□□□□ -0.61
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