Protein–RNA interactions for Protein: Q12116

TMS1, Membrane protein TMS1, yeastyeast

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TMS1Q12116 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.24□□□□□ -0.93
TMS1Q12116 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.24□□□□□ -0.93
TMS1Q12116 RAD51YER095W 1203 nt9.2□□□□□ -0.94
TMS1Q12116 GDH3YAL062W 1374 nt9.2□□□□□ -0.94
TMS1Q12116 DUT1YBR252W 444 nt9.18□□□□□ -0.94
TMS1Q12116 STR3YGL184C 1398 nt9.17□□□□□ -0.94
TMS1Q12116 YGR201CYGR201C 678 nt9.17□□□□□ -0.94
TMS1Q12116 COQ2YNR041C 1119 nt9.17□□□□□ -0.94
TMS1Q12116 YNR029CYNR029C 1290 nt9.12□□□□□ -0.95
TMS1Q12116 STE4YOR212W 1272 nt9.12□□□□□ -0.95
TMS1Q12116 SDH5YOL071W 489 nt9.11□□□□□ -0.95
TMS1Q12116 RPL4BYDR012W 1089 nt9.1□□□□□ -0.95
TMS1Q12116 RPL4AYBR031W 1089 nt9.1□□□□□ -0.95
TMS1Q12116 YAT1YAR035W 2064 nt9.09□□□□□ -0.95
TMS1Q12116 RAD23YEL037C 1197 nt9.09□□□□□ -0.95
TMS1Q12116 YLR349WYLR349W 507 nt9.07□□□□□ -0.96
TMS1Q12116 CMP2YML057W 1815 nt9.07□□□□□ -0.96
TMS1Q12116 HSL7YBR133C 2484 nt9.06□□□□□ -0.96
TMS1Q12116 SFA1YDL168W 1161 nt9.06□□□□□ -0.96
TMS1Q12116 CLB6YGR109C 1143 nt9.06□□□□□ -0.96
TMS1Q12116 AVT6YER119C 1347 nt9.05□□□□□ -0.96
TMS1Q12116 AQY2YLL052C 450 nt9.04□□□□□ -0.96
TMS1Q12116 YCR102CYCR102C 1107 nt9.03□□□□□ -0.96
TMS1Q12116 ADH7YCR105W 1086 nt9.03□□□□□ -0.96
TMS1Q12116 RTN2YDL204W 1182 nt9.03□□□□□ -0.96
TMS1Q12116 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.03□□□□□ -0.96
TMS1Q12116 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt9.03□□□□□ -0.96
TMS1Q12116 RPS14BYJL191W 417 nt9.02□□□□□ -0.97
TMS1Q12116 PAU15YIR041W 375 nt9.01□□□□□ -0.97
TMS1Q12116 FUN14YAL008W 597 nt9.01□□□□□ -0.97
TMS1Q12116 GOR1YNL274C 1053 nt9.01□□□□□ -0.97
TMS1Q12116 UTH1YKR042W 1098 nt8.98□□□□□ -0.97
TMS1Q12116 RIB3YDR487C 627 nt8.97□□□□□ -0.97
TMS1Q12116 TSC10YBR265W 963 nt8.96□□□□□ -0.98
TMS1Q12116 YJL195CYJL195C 702 nt8.95□□□□□ -0.98
TMS1Q12116 YGR012WYGR012W 1182 nt8.94□□□□□ -0.98
TMS1Q12116 FRE6YLL051C 2139 nt8.94□□□□□ -0.98
TMS1Q12116 YLR279WYLR279W 390 nt8.94□□□□□ -0.98
TMS1Q12116 CAB5YDR196C 726 nt8.91□□□□□ -0.98
TMS1Q12116 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.89□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.89□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 PLB1YMR008C 1995 nt8.89□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 TIR3YIL011W 810 nt8.88□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 HIF1YLL022C 1158 nt8.87□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 TOM6YOR045W 186 nt8.87□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 NRT1YOR071C 1797 nt8.86□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 RPC82YPR190C 1965 nt8.86□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 SHH4YLR164W 507 nt8.86□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 ADH1YOL086C 1047 nt8.86□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 HIP1YGR191W 1812 nt8.86□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 SPT20YOL148C 1815 nt8.86□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 ARP6YLR085C 1317 nt8.84□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 NBP35YGL091C 987 nt8.84□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 PRM5YIL117C 957 nt8.84□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 PEX2YJL210W 816 nt8.84□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 GPN2YOR262W 1044 nt8.84□□□□□ -0.99
TMS1Q12116 ESS1YJR017C 513 nt8.83□□□□□ -1
TMS1Q12116 YEL008WYEL008W 381 nt8.82□□□□□ -1
TMS1Q12116 YPI1YFR003C 468 nt8.82□□□□□ -1
TMS1Q12116 CPD1YGR247W 720 nt8.82□□□□□ -1
TMS1Q12116 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.82□□□□□ -1
TMS1Q12116 YML089CYML089C 369 nt8.82□□□□□ -1
TMS1Q12116 SSN3YPL042C 1668 nt8.81□□□□□ -1
TMS1Q12116 POM34YLR018C 900 nt8.81□□□□□ -1
TMS1Q12116 MET28YIR017C 564 nt8.8□□□□□ -1
TMS1Q12116 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt8.8□□□□□ -1
TMS1Q12116 ALD4YOR374W 1560 nt8.8□□□□□ -1
TMS1Q12116 INA1YLR413W 2028 nt8.78□□□□□ -1
TMS1Q12116 LSC2YGR244C 1284 nt8.75□□□□□ -1.01
TMS1Q12116 MSB4YOL112W 1479 nt8.75□□□□□ -1.01
TMS1Q12116 NAP1YKR048C 1254 nt8.74□□□□□ -1.01
TMS1Q12116 FIT3YOR383C 615 nt8.74□□□□□ -1.01
TMS1Q12116 TIF6YPR016C 738 nt8.74□□□□□ -1.01
TMS1Q12116 UTR1YJR049C 1593 nt8.73□□□□□ -1.01
TMS1Q12116 PRO1YDR300C 1287 nt8.72□□□□□ -1.01
TMS1Q12116 LOT5YKL183W 921 nt8.71□□□□□ -1.02
TMS1Q12116 SEN2YLR105C 1134 nt8.71□□□□□ -1.02
TMS1Q12116 GND1YHR183W 1470 nt8.7□□□□□ -1.02
TMS1Q12116 ATG15YCR068W 1563 nt8.7□□□□□ -1.02
TMS1Q12116 PUP1YOR157C 786 nt8.68□□□□□ -1.02
TMS1Q12116 HEL2YDR266C 1920 nt8.66□□□□□ -1.02
TMS1Q12116 GAP1YKR039W 1809 nt8.65□□□□□ -1.02
TMS1Q12116 ZRT3YKL175W 1512 nt8.64□□□□□ -1.03
TMS1Q12116 MUP1YGR055W 1725 nt8.63□□□□□ -1.03
TMS1Q12116 RIM8YGL045W 1629 nt8.62□□□□□ -1.03
TMS1Q12116 GID7YCL039W 2238 nt8.62□□□□□ -1.03
TMS1Q12116 APT2YDR441C 546 nt8.61□□□□□ -1.03
TMS1Q12116 BSP1YPR171W 1731 nt8.6□□□□□ -1.03
TMS1Q12116 YJL067WYJL067W 351 nt8.6□□□□□ -1.03
TMS1Q12116 HOL1YNR055C 1761 nt8.6□□□□□ -1.03
TMS1Q12116 YGL114WYGL114W 2178 nt8.59□□□□□ -1.03
TMS1Q12116 SAM35YHR083W 990 nt8.57□□□□□ -1.04
TMS1Q12116 LSB3YFR024C-A 1380 nt8.56□□□□□ -1.04
TMS1Q12116 SMM1YNR015W 1155 nt8.55□□□□□ -1.04
TMS1Q12116 DBP1YPL119C 1854 nt8.55□□□□□ -1.04
TMS1Q12116 ALP1YNL270C 1722 nt8.54□□□□□ -1.04
TMS1Q12116 PGC1YPL206C 966 nt8.54□□□□□ -1.04
TMS1Q12116 YBR232CYBR232C 360 nt8.54□□□□□ -1.04
TMS1Q12116 PAU5YFL020C 369 nt8.53□□□□□ -1.04
TMS1Q12116 RIB2YOL066C 1776 nt8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.3 ms