Protein–RNA interactions for Protein: Q12080

NOP53, Ribosome biogenesis protein NOP53, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NOP53Q12080 YGR201CYGR201C 678 nt12.81□□□□□ -0.36
NOP53Q12080 PET20YPL159C 762 nt12.8□□□□□ -0.36
NOP53Q12080 PTK1YKL198C 1989 nt12.8□□□□□ -0.36
NOP53Q12080 AVT6YER119C 1347 nt12.76□□□□□ -0.37
NOP53Q12080 MRP20YDR405W 792 nt12.73□□□□□ -0.37
NOP53Q12080 YMR226CYMR226C 804 nt12.73□□□□□ -0.37
NOP53Q12080 COQ2YNR041C 1119 nt12.71□□□□□ -0.37
NOP53Q12080 YJL118WYJL118W 660 nt12.69□□□□□ -0.38
NOP53Q12080 GOR1YNL274C 1053 nt12.67□□□□□ -0.38
NOP53Q12080 YCR099CYCR099C 468 nt12.66□□□□□ -0.38
NOP53Q12080 HMT1YBR034C 1047 nt12.66□□□□□ -0.38
NOP53Q12080 YFL054CYFL054C 1941 nt12.65□□□□□ -0.38
NOP53Q12080 SFA1YDL168W 1161 nt12.65□□□□□ -0.38
NOP53Q12080 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt12.65□□□□□ -0.38
NOP53Q12080 DUT1YBR252W 444 nt12.64□□□□□ -0.39
NOP53Q12080 ALG12YNR030W 1656 nt12.64□□□□□ -0.39
NOP53Q12080 YCR102CYCR102C 1107 nt12.63□□□□□ -0.39
NOP53Q12080 SAM1YLR180W 1149 nt12.61□□□□□ -0.39
NOP53Q12080 snR78snR78 87 nt12.6□□□□□ -0.39
NOP53Q12080 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.6□□□□□ -0.39
NOP53Q12080 SKG1YKR100C 1068 nt12.6□□□□□ -0.39
NOP53Q12080 AGP1YCL025C 1902 nt12.59□□□□□ -0.39
NOP53Q12080 YLR111WYLR111W 333 nt12.59□□□□□ -0.39
NOP53Q12080 YPL071CYPL071C 471 nt12.59□□□□□ -0.39
NOP53Q12080 YHM2YMR241W 945 nt12.55□□□□□ -0.4
NOP53Q12080 CCA1YER168C 1641 nt12.55□□□□□ -0.4
NOP53Q12080 RPL4BYDR012W 1089 nt12.54□□□□□ -0.4
NOP53Q12080 RPL4AYBR031W 1089 nt12.54□□□□□ -0.4
NOP53Q12080 SHH4YLR164W 507 nt12.49□□□□□ -0.41
NOP53Q12080 SDH5YOL071W 489 nt12.49□□□□□ -0.41
NOP53Q12080 AI3Q0060 1248 nt12.47□□□□□ -0.41
NOP53Q12080 RPS14BYJL191W 417 nt12.47□□□□□ -0.41
NOP53Q12080 NBP35YGL091C 987 nt12.45□□□□□ -0.42
NOP53Q12080 YJR154WYJR154W 1041 nt12.45□□□□□ -0.42
NOP53Q12080 YNR068CYNR068C 819 nt12.44□□□□□ -0.42
NOP53Q12080 TIR3YIL011W 810 nt12.43□□□□□ -0.42
NOP53Q12080 TOM6YOR045W 186 nt12.42□□□□□ -0.42
NOP53Q12080 RAD23YEL037C 1197 nt12.41□□□□□ -0.42
NOP53Q12080 HSP60YLR259C 1719 nt12.41□□□□□ -0.42
NOP53Q12080 YJL225CYJL225C 5277 nt12.41□□□□□ -0.42
NOP53Q12080 RAD51YER095W 1203 nt12.4□□□□□ -0.42
NOP53Q12080 UTH1YKR042W 1098 nt12.4□□□□□ -0.42
NOP53Q12080 SWE1YJL187C 2460 nt12.38□□□□□ -0.43
NOP53Q12080 CAB5YDR196C 726 nt12.37□□□□□ -0.43
NOP53Q12080 PEX2YJL210W 816 nt12.37□□□□□ -0.43
NOP53Q12080 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.37□□□□□ -0.43
NOP53Q12080 POM34YLR018C 900 nt12.35□□□□□ -0.43
NOP53Q12080 DUS1YML080W 1272 nt12.35□□□□□ -0.43
NOP53Q12080 HIP1YGR191W 1812 nt12.34□□□□□ -0.43
NOP53Q12080 YGR012WYGR012W 1182 nt12.33□□□□□ -0.44
NOP53Q12080 URE2YNL229C 1065 nt12.33□□□□□ -0.44
NOP53Q12080 TSC10YBR265W 963 nt12.33□□□□□ -0.44
NOP53Q12080 NRT1YOR071C 1797 nt12.31□□□□□ -0.44
NOP53Q12080 AQY2YLL052C 450 nt12.31□□□□□ -0.44
NOP53Q12080 NAR1YNL240C 1476 nt12.31□□□□□ -0.44
NOP53Q12080 STR3YGL184C 1398 nt12.3□□□□□ -0.44
NOP53Q12080 YPL041CYPL041C 624 nt12.3□□□□□ -0.44
NOP53Q12080 PRO1YDR300C 1287 nt12.29□□□□□ -0.44
NOP53Q12080 RIB3YDR487C 627 nt12.28□□□□□ -0.44
NOP53Q12080 YML089CYML089C 369 nt12.28□□□□□ -0.44
NOP53Q12080 RPM1RPM1 483 nt12.27□□□□□ -0.45
NOP53Q12080 PAB1YER165W 1734 nt12.26□□□□□ -0.45
NOP53Q12080 STE4YOR212W 1272 nt12.25□□□□□ -0.45
NOP53Q12080 LSC2YGR244C 1284 nt12.24□□□□□ -0.45
NOP53Q12080 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.24□□□□□ -0.45
NOP53Q12080 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.24□□□□□ -0.45
NOP53Q12080 TIF6YPR016C 738 nt12.24□□□□□ -0.45
NOP53Q12080 MET28YIR017C 564 nt12.23□□□□□ -0.45
NOP53Q12080 YNR029CYNR029C 1290 nt12.22□□□□□ -0.45
NOP53Q12080 ATG15YCR068W 1563 nt12.22□□□□□ -0.45
NOP53Q12080 YLR279WYLR279W 390 nt12.21□□□□□ -0.45
NOP53Q12080 YLR349WYLR349W 507 nt12.21□□□□□ -0.45
NOP53Q12080 COG1YGL223C 1254 nt12.2□□□□□ -0.46
NOP53Q12080 YCL074WYCL074W 927 nt12.18□□□□□ -0.46
NOP53Q12080 FTH1YBR207W 1398 nt12.18□□□□□ -0.46
NOP53Q12080 FUN14YAL008W 597 nt12.17□□□□□ -0.46
NOP53Q12080 YJL107CYJL107C 1164 nt12.17□□□□□ -0.46
NOP53Q12080 YJL195CYJL195C 702 nt12.16□□□□□ -0.46
NOP53Q12080 MSB4YOL112W 1479 nt12.15□□□□□ -0.46
NOP53Q12080 THP3YPR045C 1413 nt12.13□□□□□ -0.47
NOP53Q12080 ADH7YCR105W 1086 nt12.12□□□□□ -0.47
NOP53Q12080 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.12□□□□□ -0.47
NOP53Q12080 YPL168WYPL168W 1293 nt12.11□□□□□ -0.47
NOP53Q12080 ARP6YLR085C 1317 nt12.11□□□□□ -0.47
NOP53Q12080 CMP2YML057W 1815 nt12.1□□□□□ -0.47
NOP53Q12080 ADH1YOL086C 1047 nt12.1□□□□□ -0.47
NOP53Q12080 FIT3YOR383C 615 nt12.1□□□□□ -0.47
NOP53Q12080 RDN37-1RDN37-1 5354 nt12.1□□□□□ -0.47
NOP53Q12080 RDN37-2RDN37-2 5354 nt12.1□□□□□ -0.47
NOP53Q12080 Q0142Q0142 177 nt12.09□□□□□ -0.47
NOP53Q12080 PAU15YIR041W 375 nt12.09□□□□□ -0.47
NOP53Q12080 HSL7YBR133C 2484 nt12.08□□□□□ -0.48
NOP53Q12080 GAP1YKR039W 1809 nt12.07□□□□□ -0.48
NOP53Q12080 YTH1YPR107C 627 nt12.06□□□□□ -0.48
NOP53Q12080 RSM23YGL129C 1353 nt12.05□□□□□ -0.48
NOP53Q12080 YPI1YFR003C 468 nt12.04□□□□□ -0.48
NOP53Q12080 BNS1YGR230W 414 nt12.04□□□□□ -0.48
NOP53Q12080 LSM12YHR121W 564 nt12.04□□□□□ -0.48
NOP53Q12080 LOT5YKL183W 921 nt12.01□□□□□ -0.49
NOP53Q12080 YEL074WYEL074W 339 nt12□□□□□ -0.49
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