Protein–RNA interactions for Protein: Q08646

SSP2, Sporulation-specific protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSP2Q08646 NRT1YOR071C 1797 nt12.27□□□□□ -0.45
SSP2Q08646 STR3YGL184C 1398 nt12.27□□□□□ -0.45
SSP2Q08646 YGR012WYGR012W 1182 nt12.26□□□□□ -0.45
SSP2Q08646 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt12.25□□□□□ -0.45
SSP2Q08646 YML089CYML089C 369 nt12.25□□□□□ -0.45
SSP2Q08646 PRO1YDR300C 1287 nt12.24□□□□□ -0.45
SSP2Q08646 LSC2YGR244C 1284 nt12.22□□□□□ -0.45
SSP2Q08646 CAB5YDR196C 726 nt12.21□□□□□ -0.45
SSP2Q08646 RAD51YER095W 1203 nt12.21□□□□□ -0.45
SSP2Q08646 RIB3YDR487C 627 nt12.2□□□□□ -0.46
SSP2Q08646 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.2□□□□□ -0.46
SSP2Q08646 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.2□□□□□ -0.46
SSP2Q08646 ATG15YCR068W 1563 nt12.19□□□□□ -0.46
SSP2Q08646 YCL074WYCL074W 927 nt12.19□□□□□ -0.46
SSP2Q08646 MET28YIR017C 564 nt12.19□□□□□ -0.46
SSP2Q08646 TIF6YPR016C 738 nt12.17□□□□□ -0.46
SSP2Q08646 YLR279WYLR279W 390 nt12.13□□□□□ -0.47
SSP2Q08646 STE4YOR212W 1272 nt12.13□□□□□ -0.47
SSP2Q08646 FIT3YOR383C 615 nt12.08□□□□□ -0.48
SSP2Q08646 YNR029CYNR029C 1290 nt12.07□□□□□ -0.48
SSP2Q08646 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.07□□□□□ -0.48
SSP2Q08646 MSB4YOL112W 1479 nt12.07□□□□□ -0.48
SSP2Q08646 ARP6YLR085C 1317 nt12.07□□□□□ -0.48
SSP2Q08646 FUN14YAL008W 597 nt12.06□□□□□ -0.48
SSP2Q08646 YLR349WYLR349W 507 nt12.06□□□□□ -0.48
SSP2Q08646 YJL195CYJL195C 702 nt12.05□□□□□ -0.48
SSP2Q08646 GAP1YKR039W 1809 nt12.04□□□□□ -0.48
SSP2Q08646 RPM1RPM1 483 nt12.04□□□□□ -0.48
SSP2Q08646 ADH7YCR105W 1086 nt12.01□□□□□ -0.49
SSP2Q08646 RTN2YDL204W 1182 nt11.99□□□□□ -0.49
SSP2Q08646 ADH1YOL086C 1047 nt11.99□□□□□ -0.49
SSP2Q08646 PAU15YIR041W 375 nt11.98□□□□□ -0.49
SSP2Q08646 YPI1YFR003C 468 nt11.97□□□□□ -0.49
SSP2Q08646 PLB1YMR008C 1995 nt11.95□□□□□ -0.5
SSP2Q08646 FUR4YBR021W 1902 nt11.95□□□□□ -0.5
SSP2Q08646 LOT5YKL183W 921 nt11.94□□□□□ -0.5
SSP2Q08646 GND1YHR183W 1470 nt11.93□□□□□ -0.5
SSP2Q08646 YJL225CYJL225C 5277 nt11.92□□□□□ -0.5
SSP2Q08646 AAC1YMR056C 930 nt11.9□□□□□ -0.5
SSP2Q08646 GPN2YOR262W 1044 nt11.89□□□□□ -0.51
SSP2Q08646 YAR028WYAR028W 705 nt11.88□□□□□ -0.51
SSP2Q08646 ALP1YNL270C 1722 nt11.88□□□□□ -0.51
SSP2Q08646 DIF1YLR437C 402 nt11.87□□□□□ -0.51
SSP2Q08646 YEL008WYEL008W 381 nt11.86□□□□□ -0.51
SSP2Q08646 ZTA1YBR046C 1005 nt11.86□□□□□ -0.51
SSP2Q08646 AKR2YOR034C 2250 nt11.86□□□□□ -0.51
SSP2Q08646 PAC11YDR488C 1602 nt11.85□□□□□ -0.51
SSP2Q08646 APT2YDR441C 546 nt11.84□□□□□ -0.51
SSP2Q08646 MTG2YHR168W 1557 nt11.82□□□□□ -0.52
SSP2Q08646 CPD1YGR247W 720 nt11.81□□□□□ -0.52
SSP2Q08646 SMM1YNR015W 1155 nt11.81□□□□□ -0.52
SSP2Q08646 UTR1YJR049C 1593 nt11.8□□□□□ -0.52
SSP2Q08646 YGR259CYGR259C 441 nt11.79□□□□□ -0.52
SSP2Q08646 YKR005CYKR005C 1578 nt11.76□□□□□ -0.53
SSP2Q08646 LSB3YFR024C-A 1380 nt11.76□□□□□ -0.53
SSP2Q08646 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.75□□□□□ -0.53
SSP2Q08646 FCY21YER060W 1587 nt11.72□□□□□ -0.53
SSP2Q08646 ESS1YJR017C 513 nt11.72□□□□□ -0.53
SSP2Q08646 RIB2YOL066C 1776 nt11.72□□□□□ -0.53
SSP2Q08646 SAM35YHR083W 990 nt11.7□□□□□ -0.54
SSP2Q08646 SED1YDR077W 1017 nt11.66□□□□□ -0.54
SSP2Q08646 PRY1YJL079C 900 nt11.65□□□□□ -0.54
SSP2Q08646 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.64□□□□□ -0.55
SSP2Q08646 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.64□□□□□ -0.55
SSP2Q08646 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.64□□□□□ -0.55
SSP2Q08646 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.64□□□□□ -0.55
SSP2Q08646 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.64□□□□□ -0.55
SSP2Q08646 PRP4YPR178W 1398 nt11.64□□□□□ -0.55
SSP2Q08646 VRG4YGL225W 1014 nt11.63□□□□□ -0.55
SSP2Q08646 UGA4YDL210W 1716 nt11.62□□□□□ -0.55
SSP2Q08646 PRM5YIL117C 957 nt11.61□□□□□ -0.55
SSP2Q08646 BMT6YLR063W 1098 nt11.61□□□□□ -0.55
SSP2Q08646 HXT12YIL170W 1374 nt11.61□□□□□ -0.55
SSP2Q08646 NVJ2YPR091C 2313 nt11.61□□□□□ -0.55
SSP2Q08646 LIP1YMR298W 453 nt11.58□□□□□ -0.56
SSP2Q08646 HSP60YLR259C 1719 nt11.57□□□□□ -0.56
SSP2Q08646 YJL055WYJL055W 738 nt11.55□□□□□ -0.56
SSP2Q08646 DPS1YLL018C 1674 nt11.55□□□□□ -0.56
SSP2Q08646 SEN2YLR105C 1134 nt11.54□□□□□ -0.56
SSP2Q08646 ALD4YOR374W 1560 nt11.51□□□□□ -0.57
SSP2Q08646 PAU5YFL020C 369 nt11.5□□□□□ -0.57
SSP2Q08646 NAP1YKR048C 1254 nt11.5□□□□□ -0.57
SSP2Q08646 IRC24YIR036C 792 nt11.48□□□□□ -0.57
SSP2Q08646 YPL251WYPL251W 303 nt11.48□□□□□ -0.57
SSP2Q08646 MEP3YPR138C 1470 nt11.48□□□□□ -0.57
SSP2Q08646 PGC1YPL206C 966 nt11.46□□□□□ -0.57
SSP2Q08646 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.46□□□□□ -0.57
SSP2Q08646 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.46□□□□□ -0.57
SSP2Q08646 HXT1YHR094C 1713 nt11.46□□□□□ -0.58
SSP2Q08646 YMR103CYMR103C 363 nt11.45□□□□□ -0.58
SSP2Q08646 BRR1YPR057W 1026 nt11.45□□□□□ -0.58
SSP2Q08646 CCT5YJR064W 1689 nt11.45□□□□□ -0.58
SSP2Q08646 DBP1YPL119C 1854 nt11.44□□□□□ -0.58
SSP2Q08646 YBL086CYBL086C 1401 nt11.44□□□□□ -0.58
SSP2Q08646 TOA2YKL058W 369 nt11.44□□□□□ -0.58
SSP2Q08646 PUP1YOR157C 786 nt11.43□□□□□ -0.58
SSP2Q08646 LSB5YCL034W 1065 nt11.43□□□□□ -0.58
SSP2Q08646 CSM1YCR086W 573 nt11.42□□□□□ -0.58
SSP2Q08646 LEU9YOR108W 1815 nt11.4□□□□□ -0.58
SSP2Q08646 STP3YLR375W 1032 nt11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 9.4 ms