Protein–RNA interactions for Protein: Q08387

DNL4, DNA ligase 4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 944 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNL4Q08387 RPM1RPM1 483 nt10.6□□□□□ -0.71
DNL4Q08387 HSP60YLR259C 1719 nt10.59□□□□□ -0.71
DNL4Q08387 AQY2YLL052C 450 nt10.59□□□□□ -0.71
DNL4Q08387 TOM6YOR045W 186 nt10.58□□□□□ -0.72
DNL4Q08387 STR3YGL184C 1398 nt10.56□□□□□ -0.72
DNL4Q08387 RAD23YEL037C 1197 nt10.56□□□□□ -0.72
DNL4Q08387 POM34YLR018C 900 nt10.55□□□□□ -0.72
DNL4Q08387 YML089CYML089C 369 nt10.55□□□□□ -0.72
DNL4Q08387 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.55□□□□□ -0.72
DNL4Q08387 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.55□□□□□ -0.72
DNL4Q08387 YCL074WYCL074W 927 nt10.54□□□□□ -0.72
DNL4Q08387 PEX2YJL210W 816 nt10.54□□□□□ -0.72
DNL4Q08387 HIP1YGR191W 1812 nt10.54□□□□□ -0.72
DNL4Q08387 LSC2YGR244C 1284 nt10.53□□□□□ -0.72
DNL4Q08387 TSC10YBR265W 963 nt10.53□□□□□ -0.72
DNL4Q08387 NAR1YNL240C 1476 nt10.53□□□□□ -0.72
DNL4Q08387 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.51□□□□□ -0.73
DNL4Q08387 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.51□□□□□ -0.73
DNL4Q08387 NRT1YOR071C 1797 nt10.51□□□□□ -0.73
DNL4Q08387 PRO1YDR300C 1287 nt10.5□□□□□ -0.73
DNL4Q08387 YGR012WYGR012W 1182 nt10.48□□□□□ -0.73
DNL4Q08387 ATG15YCR068W 1563 nt10.48□□□□□ -0.73
DNL4Q08387 MET28YIR017C 564 nt10.46□□□□□ -0.73
DNL4Q08387 TIF6YPR016C 738 nt10.45□□□□□ -0.74
DNL4Q08387 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.44□□□□□ -0.74
DNL4Q08387 RIB3YDR487C 627 nt10.42□□□□□ -0.74
DNL4Q08387 ARP6YLR085C 1317 nt10.41□□□□□ -0.74
DNL4Q08387 HSL7YBR133C 2484 nt10.39□□□□□ -0.75
DNL4Q08387 RTN2YDL204W 1182 nt10.39□□□□□ -0.75
DNL4Q08387 FIT3YOR383C 615 nt10.39□□□□□ -0.75
DNL4Q08387 CAB5YDR196C 726 nt10.38□□□□□ -0.75
DNL4Q08387 YLR279WYLR279W 390 nt10.38□□□□□ -0.75
DNL4Q08387 FUR4YBR021W 1902 nt10.37□□□□□ -0.75
DNL4Q08387 GAP1YKR039W 1809 nt10.36□□□□□ -0.75
DNL4Q08387 CMP2YML057W 1815 nt10.35□□□□□ -0.75
DNL4Q08387 MSB4YOL112W 1479 nt10.32□□□□□ -0.76
DNL4Q08387 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.31□□□□□ -0.76
DNL4Q08387 PLB1YMR008C 1995 nt10.3□□□□□ -0.76
DNL4Q08387 RAD51YER095W 1203 nt10.29□□□□□ -0.76
DNL4Q08387 STE4YOR212W 1272 nt10.29□□□□□ -0.76
DNL4Q08387 HEL2YDR266C 1920 nt10.29□□□□□ -0.76
DNL4Q08387 FUN14YAL008W 597 nt10.25□□□□□ -0.77
DNL4Q08387 YJL195CYJL195C 702 nt10.24□□□□□ -0.77
DNL4Q08387 YAR028WYAR028W 705 nt10.24□□□□□ -0.77
DNL4Q08387 YLR349WYLR349W 507 nt10.24□□□□□ -0.77
DNL4Q08387 YPI1YFR003C 468 nt10.23□□□□□ -0.77
DNL4Q08387 YGR259CYGR259C 441 nt10.21□□□□□ -0.77
DNL4Q08387 LOT5YKL183W 921 nt10.21□□□□□ -0.77
DNL4Q08387 DIF1YLR437C 402 nt10.21□□□□□ -0.77
DNL4Q08387 ALP1YNL270C 1722 nt10.21□□□□□ -0.78
DNL4Q08387 GND1YHR183W 1470 nt10.2□□□□□ -0.78
DNL4Q08387 ADH1YOL086C 1047 nt10.2□□□□□ -0.78
DNL4Q08387 YKR005CYKR005C 1578 nt10.19□□□□□ -0.78
DNL4Q08387 YNR029CYNR029C 1290 nt10.19□□□□□ -0.78
DNL4Q08387 AKR2YOR034C 2250 nt10.18□□□□□ -0.78
DNL4Q08387 ADH7YCR105W 1086 nt10.17□□□□□ -0.78
DNL4Q08387 UTR1YJR049C 1593 nt10.17□□□□□ -0.78
DNL4Q08387 ZTA1YBR046C 1005 nt10.16□□□□□ -0.78
DNL4Q08387 MTG2YHR168W 1557 nt10.15□□□□□ -0.78
DNL4Q08387 AAC1YMR056C 930 nt10.14□□□□□ -0.79
DNL4Q08387 PRP4YPR178W 1398 nt10.13□□□□□ -0.79
DNL4Q08387 RDN25-1RDN25-1 3396 nt10.12□□□□□ -0.79
DNL4Q08387 RDN25-2RDN25-2 3396 nt10.12□□□□□ -0.79
DNL4Q08387 SAM35YHR083W 990 nt10.12□□□□□ -0.79
DNL4Q08387 PAU15YIR041W 375 nt10.12□□□□□ -0.79
DNL4Q08387 BMT6YLR063W 1098 nt10.1□□□□□ -0.79
DNL4Q08387 MET2YNL277W 1461 nt10.1□□□□□ -0.79
DNL4Q08387 YEL008WYEL008W 381 nt10.09□□□□□ -0.79
DNL4Q08387 PBP1YGR178C 2169 nt10.08□□□□□ -0.8
DNL4Q08387 APT2YDR441C 546 nt10.08□□□□□ -0.8
DNL4Q08387 CYT2YKL087C 675 nt10.08□□□□□ -0.8
DNL4Q08387 SMM1YNR015W 1155 nt10.08□□□□□ -0.8
DNL4Q08387 DPS1YLL018C 1674 nt10.06□□□□□ -0.8
DNL4Q08387 FCY21YER060W 1587 nt10.06□□□□□ -0.8
DNL4Q08387 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.06□□□□□ -0.8
DNL4Q08387 GPN2YOR262W 1044 nt10.06□□□□□ -0.8
DNL4Q08387 YAT1YAR035W 2064 nt10.05□□□□□ -0.8
DNL4Q08387 SFP1YLR403W 2052 nt10.05□□□□□ -0.8
DNL4Q08387 SED1YDR077W 1017 nt10.05□□□□□ -0.8
DNL4Q08387 BIO5YNR056C 1686 nt10.03□□□□□ -0.8
DNL4Q08387 CPD1YGR247W 720 nt10.03□□□□□ -0.8
DNL4Q08387 PRM5YIL117C 957 nt10.02□□□□□ -0.81
DNL4Q08387 RIB2YOL066C 1776 nt9.99□□□□□ -0.81
DNL4Q08387 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.99□□□□□ -0.81
DNL4Q08387 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.99□□□□□ -0.81
DNL4Q08387 PRY1YJL079C 900 nt9.99□□□□□ -0.81
DNL4Q08387 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.99□□□□□ -0.81
DNL4Q08387 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.99□□□□□ -0.81
DNL4Q08387 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.99□□□□□ -0.81
DNL4Q08387 NPP1YCR026C 2229 nt9.97□□□□□ -0.81
DNL4Q08387 IRC24YIR036C 792 nt9.97□□□□□ -0.81
DNL4Q08387 LIP1YMR298W 453 nt9.97□□□□□ -0.81
DNL4Q08387 UGA4YDL210W 1716 nt9.96□□□□□ -0.81
DNL4Q08387 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt9.95□□□□□ -0.82
DNL4Q08387 HXT12YIL170W 1374 nt9.95□□□□□ -0.82
DNL4Q08387 VRG4YGL225W 1014 nt9.94□□□□□ -0.82
DNL4Q08387 ESS1YJR017C 513 nt9.94□□□□□ -0.82
DNL4Q08387 SSN3YPL042C 1668 nt9.91□□□□□ -0.82
DNL4Q08387 SNF1YDR477W 1902 nt9.9□□□□□ -0.83
DNL4Q08387 YPL251WYPL251W 303 nt9.89□□□□□ -0.83
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