Protein–RNA interactions for Protein: Q08236

AVO1, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO1Q08236 DUS1YML080W 1272 nt9.44□□□□□ -0.9
AVO1Q08236 PAU16YKL224C 372 nt9.43□□□□□ -0.9
AVO1Q08236 THI72YOR192C 1800 nt9.42□□□□□ -0.9
AVO1Q08236 GOR1YNL274C 1053 nt9.42□□□□□ -0.9
AVO1Q08236 FUR4YBR021W 1902 nt9.41□□□□□ -0.9
AVO1Q08236 LCP5YER127W 1074 nt9.41□□□□□ -0.9
AVO1Q08236 FRA1YLL029W 2250 nt9.4□□□□□ -0.9
AVO1Q08236 DUT1YBR252W 444 nt9.4□□□□□ -0.9
AVO1Q08236 NIT1YIL164C 600 nt9.39□□□□□ -0.91
AVO1Q08236 SGT2YOR007C 1041 nt9.38□□□□□ -0.91
AVO1Q08236 ABZ2YMR289W 1125 nt9.37□□□□□ -0.91
AVO1Q08236 Q0010Q0010 387 nt9.37□□□□□ -0.91
AVO1Q08236 YCL074WYCL074W 927 nt9.36□□□□□ -0.91
AVO1Q08236 BUR6YER159C 429 nt9.35□□□□□ -0.91
AVO1Q08236 NRT1YOR071C 1797 nt9.35□□□□□ -0.91
AVO1Q08236 PAU7YAR020C 168 nt9.34□□□□□ -0.91
AVO1Q08236 GLK1YCL040W 1503 nt9.32□□□□□ -0.92
AVO1Q08236 PBP1YGR178C 2169 nt9.32□□□□□ -0.92
AVO1Q08236 CYT2YKL087C 675 nt9.32□□□□□ -0.92
AVO1Q08236 DAT1YML113W 747 nt9.32□□□□□ -0.92
AVO1Q08236 URH1YDR400W 1023 nt9.31□□□□□ -0.92
AVO1Q08236 STR3YGL184C 1398 nt9.29□□□□□ -0.92
AVO1Q08236 MIR1YJR077C 936 nt9.29□□□□□ -0.92
AVO1Q08236 AQY2YLL052C 450 nt9.29□□□□□ -0.92
AVO1Q08236 RDN18-1RDN18-1 1800 nt9.28□□□□□ -0.92
AVO1Q08236 RDN18-2RDN18-2 1800 nt9.28□□□□□ -0.92
AVO1Q08236 YCR102CYCR102C 1107 nt9.27□□□□□ -0.93
AVO1Q08236 TOM20YGR082W 552 nt9.27□□□□□ -0.93
AVO1Q08236 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt9.25□□□□□ -0.93
AVO1Q08236 ACO2YJL200C 2370 nt9.24□□□□□ -0.93
AVO1Q08236 SHB17YKR043C 816 nt9.24□□□□□ -0.93
AVO1Q08236 NAT4YMR069W 858 nt9.24□□□□□ -0.93
AVO1Q08236 THI74YDR438W 1113 nt9.23□□□□□ -0.93
AVO1Q08236 YJL118WYJL118W 660 nt9.23□□□□□ -0.93
AVO1Q08236 RIM8YGL045W 1629 nt9.22□□□□□ -0.93
AVO1Q08236 PRP4YPR178W 1398 nt9.22□□□□□ -0.93
AVO1Q08236 YKR005CYKR005C 1578 nt9.21□□□□□ -0.93
AVO1Q08236 AI5_BETAQ0075 1065 nt9.21□□□□□ -0.94
AVO1Q08236 PAB1YER165W 1734 nt9.21□□□□□ -0.94
AVO1Q08236 YDR010CYDR010C 333 nt9.2□□□□□ -0.94
AVO1Q08236 NBP35YGL091C 987 nt9.19□□□□□ -0.94
AVO1Q08236 UBA4YHR111W 1323 nt9.19□□□□□ -0.94
AVO1Q08236 YGL114WYGL114W 2178 nt9.18□□□□□ -0.94
AVO1Q08236 YGR259CYGR259C 441 nt9.18□□□□□ -0.94
AVO1Q08236 MSF1YPR047W 1410 nt9.18□□□□□ -0.94
AVO1Q08236 BMT5YIL096C 1011 nt9.16□□□□□ -0.94
AVO1Q08236 BMT6YLR063W 1098 nt9.16□□□□□ -0.94
AVO1Q08236 RTN2YDL204W 1182 nt9.15□□□□□ -0.94
AVO1Q08236 DPS1YLL018C 1674 nt9.15□□□□□ -0.94
AVO1Q08236 MAS1YLR163C 1389 nt9.14□□□□□ -0.95
AVO1Q08236 RET2YFR051C 1641 nt9.14□□□□□ -0.95
AVO1Q08236 YSR3YKR053C 1215 nt9.13□□□□□ -0.95
AVO1Q08236 PHO89YBR296C 1725 nt9.12□□□□□ -0.95
AVO1Q08236 SRN2YLR119W 642 nt9.12□□□□□ -0.95
AVO1Q08236 NDI1YML120C 1542 nt9.11□□□□□ -0.95
AVO1Q08236 TIR3YIL011W 810 nt9.11□□□□□ -0.95
AVO1Q08236 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt9.1□□□□□ -0.95
AVO1Q08236 YLR173WYLR173W 1827 nt9.1□□□□□ -0.95
AVO1Q08236 SHH4YLR164W 507 nt9.09□□□□□ -0.95
AVO1Q08236 SFA1YDL168W 1161 nt9.08□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 AAC1YMR056C 930 nt9.08□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 YPL041CYPL041C 624 nt9.08□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 GNP1YDR508C 1992 nt9.08□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 YGL034CYGL034C 366 nt9.07□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt9.07□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 ARP6YLR085C 1317 nt9.06□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt9.06□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 NSG2YNL156C 900 nt9.06□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 BIO5YNR056C 1686 nt9.05□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 YCR087WYCR087W 516 nt9.05□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 XYL2YLR070C 1071 nt9.05□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 LSC2YGR244C 1284 nt9.04□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 FTH1YBR207W 1398 nt9.03□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 PLB1YMR008C 1995 nt9.03□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 COG1YGL223C 1254 nt9.03□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 IRC24YIR036C 792 nt9.03□□□□□ -0.96
AVO1Q08236 PRO1YDR300C 1287 nt9.02□□□□□ -0.97
AVO1Q08236 MRP20YDR405W 792 nt9.01□□□□□ -0.97
AVO1Q08236 POM34YLR018C 900 nt9.01□□□□□ -0.97
AVO1Q08236 COQ2YNR041C 1119 nt9.01□□□□□ -0.97
AVO1Q08236 TOM71YHR117W 1920 nt9.01□□□□□ -0.97
AVO1Q08236 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt9□□□□□ -0.97
AVO1Q08236 SNF1YDR477W 1902 nt8.99□□□□□ -0.97
AVO1Q08236 TOM6YOR045W 186 nt8.99□□□□□ -0.97
AVO1Q08236 ATG15YCR068W 1563 nt8.99□□□□□ -0.97
AVO1Q08236 YML089CYML089C 369 nt8.98□□□□□ -0.97
AVO1Q08236 AIM45YPR004C 1035 nt8.98□□□□□ -0.97
AVO1Q08236 GAP1YKR039W 1809 nt8.97□□□□□ -0.97
AVO1Q08236 MTO1YGL236C 2010 nt8.96□□□□□ -0.98
AVO1Q08236 TPN1YGL186C 1740 nt8.96□□□□□ -0.98
AVO1Q08236 SFL1YOR140W 2301 nt8.96□□□□□ -0.98
AVO1Q08236 RBG1YAL036C 1110 nt8.95□□□□□ -0.98
AVO1Q08236 ILV3YJR016C 1758 nt8.94□□□□□ -0.98
AVO1Q08236 PEX2YJL210W 816 nt8.94□□□□□ -0.98
AVO1Q08236 ALR1YOL130W 2580 nt8.94□□□□□ -0.98
AVO1Q08236 YHM2YMR241W 945 nt8.93□□□□□ -0.98
AVO1Q08236 YTH1YPR107C 627 nt8.93□□□□□ -0.98
AVO1Q08236 RPL4BYDR012W 1089 nt8.91□□□□□ -0.98
AVO1Q08236 RPL4AYBR031W 1089 nt8.91□□□□□ -0.98
AVO1Q08236 UTR1YJR049C 1593 nt8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.5 ms