Protein–RNA interactions for Protein: Q06682

UBX5, UBX domain-containing protein 5, yeastyeast

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX5Q06682 SSN3YPL042C 1668 nt11.27□□□□□ -0.61
UBX5Q06682 UTH1YKR042W 1098 nt11.26□□□□□ -0.61
UBX5Q06682 YNR029CYNR029C 1290 nt11.26□□□□□ -0.61
UBX5Q06682 STE4YOR212W 1272 nt11.26□□□□□ -0.61
UBX5Q06682 TIR3YIL011W 810 nt11.25□□□□□ -0.61
UBX5Q06682 YGR012WYGR012W 1182 nt11.23□□□□□ -0.61
UBX5Q06682 PEX2YJL210W 816 nt11.23□□□□□ -0.61
UBX5Q06682 YLR349WYLR349W 507 nt11.23□□□□□ -0.61
UBX5Q06682 TSC10YBR265W 963 nt11.22□□□□□ -0.61
UBX5Q06682 HIP1YGR191W 1812 nt11.21□□□□□ -0.61
UBX5Q06682 RIB3YDR487C 627 nt11.19□□□□□ -0.62
UBX5Q06682 POM34YLR018C 900 nt11.18□□□□□ -0.62
UBX5Q06682 NRT1YOR071C 1797 nt11.18□□□□□ -0.62
UBX5Q06682 FUN14YAL008W 597 nt11.16□□□□□ -0.62
UBX5Q06682 SWE1YJL187C 2460 nt11.16□□□□□ -0.62
UBX5Q06682 ADH7YCR105W 1086 nt11.14□□□□□ -0.63
UBX5Q06682 YLR279WYLR279W 390 nt11.14□□□□□ -0.63
UBX5Q06682 YJL195CYJL195C 702 nt11.13□□□□□ -0.63
UBX5Q06682 PAU15YIR041W 375 nt11.12□□□□□ -0.63
UBX5Q06682 DUS1YML080W 1272 nt11.12□□□□□ -0.63
UBX5Q06682 PRO1YDR300C 1287 nt11.11□□□□□ -0.63
UBX5Q06682 AQY2YLL052C 450 nt11.11□□□□□ -0.63
UBX5Q06682 YML089CYML089C 369 nt11.11□□□□□ -0.63
UBX5Q06682 STR3YGL184C 1398 nt11.1□□□□□ -0.63
UBX5Q06682 MET28YIR017C 564 nt11.09□□□□□ -0.63
UBX5Q06682 TIF6YPR016C 738 nt11.09□□□□□ -0.63
UBX5Q06682 ADH1YOL086C 1047 nt11.07□□□□□ -0.64
UBX5Q06682 LSC2YGR244C 1284 nt11.06□□□□□ -0.64
UBX5Q06682 MSB4YOL112W 1479 nt11.06□□□□□ -0.64
UBX5Q06682 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.05□□□□□ -0.64
UBX5Q06682 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.05□□□□□ -0.64
UBX5Q06682 ATG15YCR068W 1563 nt11.05□□□□□ -0.64
UBX5Q06682 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.04□□□□□ -0.64
UBX5Q06682 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt11.01□□□□□ -0.65
UBX5Q06682 GPN2YOR262W 1044 nt11.01□□□□□ -0.65
UBX5Q06682 YPI1YFR003C 468 nt10.98□□□□□ -0.65
UBX5Q06682 YCL074WYCL074W 927 nt10.97□□□□□ -0.65
UBX5Q06682 FIT3YOR383C 615 nt10.97□□□□□ -0.65
UBX5Q06682 ARP6YLR085C 1317 nt10.94□□□□□ -0.66
UBX5Q06682 YEL008WYEL008W 381 nt10.94□□□□□ -0.66
UBX5Q06682 LOT5YKL183W 921 nt10.94□□□□□ -0.66
UBX5Q06682 GND1YHR183W 1470 nt10.93□□□□□ -0.66
UBX5Q06682 AAC1YMR056C 930 nt10.92□□□□□ -0.66
UBX5Q06682 CPD1YGR247W 720 nt10.91□□□□□ -0.66
UBX5Q06682 GAP1YKR039W 1809 nt10.9□□□□□ -0.66
UBX5Q06682 ESS1YJR017C 513 nt10.89□□□□□ -0.67
UBX5Q06682 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10.88□□□□□ -0.67
UBX5Q06682 UME6YDR207C 2511 nt10.88□□□□□ -0.67
UBX5Q06682 APT2YDR441C 546 nt10.86□□□□□ -0.67
UBX5Q06682 Q0010Q0010 387 nt10.84□□□□□ -0.67
UBX5Q06682 ZTA1YBR046C 1005 nt10.83□□□□□ -0.68
UBX5Q06682 MCM5YLR274W 2328 nt10.82□□□□□ -0.68
UBX5Q06682 SMM1YNR015W 1155 nt10.81□□□□□ -0.68
UBX5Q06682 PLB1YMR008C 1995 nt10.81□□□□□ -0.68
UBX5Q06682 MAS1YLR163C 1389 nt10.8□□□□□ -0.68
UBX5Q06682 RTN2YDL204W 1182 nt10.79□□□□□ -0.68
UBX5Q06682 ALP1YNL270C 1722 nt10.78□□□□□ -0.68
UBX5Q06682 YAR028WYAR028W 705 nt10.77□□□□□ -0.69
UBX5Q06682 DIF1YLR437C 402 nt10.77□□□□□ -0.69
UBX5Q06682 AKR2YOR034C 2250 nt10.77□□□□□ -0.69
UBX5Q06682 RIB2YOL066C 1776 nt10.75□□□□□ -0.69
UBX5Q06682 MTG2YHR168W 1557 nt10.75□□□□□ -0.69
UBX5Q06682 FUR4YBR021W 1902 nt10.75□□□□□ -0.69
UBX5Q06682 YJL225CYJL225C 5277 nt10.74□□□□□ -0.69
UBX5Q06682 LSB3YFR024C-A 1380 nt10.74□□□□□ -0.69
UBX5Q06682 SEN2YLR105C 1134 nt10.72□□□□□ -0.69
UBX5Q06682 FCY21YER060W 1587 nt10.71□□□□□ -0.69
UBX5Q06682 PUP1YOR157C 786 nt10.69□□□□□ -0.7
UBX5Q06682 UTR1YJR049C 1593 nt10.69□□□□□ -0.7
UBX5Q06682 NAP1YKR048C 1254 nt10.68□□□□□ -0.7
UBX5Q06682 GID7YCL039W 2238 nt10.64□□□□□ -0.71
UBX5Q06682 PRY1YJL079C 900 nt10.64□□□□□ -0.71
UBX5Q06682 PGC1YPL206C 966 nt10.63□□□□□ -0.71
UBX5Q06682 HXT12YIL170W 1374 nt10.63□□□□□ -0.71
UBX5Q06682 PAU5YFL020C 369 nt10.62□□□□□ -0.71
UBX5Q06682 ESBP6YNL125C 2022 nt10.62□□□□□ -0.71
UBX5Q06682 VRG4YGL225W 1014 nt10.61□□□□□ -0.71
UBX5Q06682 UGA4YDL210W 1716 nt10.61□□□□□ -0.71
UBX5Q06682 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.6□□□□□ -0.71
UBX5Q06682 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.6□□□□□ -0.71
UBX5Q06682 ALD4YOR374W 1560 nt10.6□□□□□ -0.71
UBX5Q06682 YBR232CYBR232C 360 nt10.59□□□□□ -0.71
UBX5Q06682 YER190C-AYER190C-A 576 nt10.58□□□□□ -0.72
UBX5Q06682 YGR259CYGR259C 441 nt10.58□□□□□ -0.72
UBX5Q06682 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt10.58□□□□□ -0.72
UBX5Q06682 YJL055WYJL055W 738 nt10.58□□□□□ -0.72
UBX5Q06682 YML133W-AYML133W-A 576 nt10.58□□□□□ -0.72
UBX5Q06682 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt10.58□□□□□ -0.72
UBX5Q06682 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt10.58□□□□□ -0.72
UBX5Q06682 YKR005CYKR005C 1578 nt10.57□□□□□ -0.72
UBX5Q06682 RSC4YKR008W 1878 nt10.54□□□□□ -0.72
UBX5Q06682 SED1YDR077W 1017 nt10.53□□□□□ -0.72
UBX5Q06682 YJL064WYJL064W 396 nt10.53□□□□□ -0.72
UBX5Q06682 YJR154WYJR154W 1041 nt10.53□□□□□ -0.72
UBX5Q06682 STP3YLR375W 1032 nt10.53□□□□□ -0.72
UBX5Q06682 HEM14YER014W 1620 nt10.51□□□□□ -0.73
UBX5Q06682 CCT5YJR064W 1689 nt10.5□□□□□ -0.73
UBX5Q06682 PRM5YIL117C 957 nt10.5□□□□□ -0.73
UBX5Q06682 YDR306CYDR306C 1437 nt10.49□□□□□ -0.73
UBX5Q06682 SAM35YHR083W 990 nt10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.5 ms