Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMX1Q04741 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMX1Q04741 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
EMX1Q04741 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMX1Q04741 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMX1Q04741 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
EMX1Q04741 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMX1Q04741 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
EMX1Q04741 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMX1Q04741 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMX1Q04741 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
EMX1Q04741 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
EMX1Q04741 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMX1Q04741 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMX1Q04741 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
EMX1Q04741 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EMX1Q04741 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EMX1Q04741 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EMX1Q04741 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMX1Q04741 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMX1Q04741 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMX1Q04741 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMX1Q04741 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EMX1Q04741 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EMX1Q04741 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EMX1Q04741 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMX1Q04741 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMX1Q04741 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMX1Q04741 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EMX1Q04741 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMX1Q04741 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EMX1Q04741 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EMX1Q04741 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMX1Q04741 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMX1Q04741 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EMX1Q04741 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
EMX1Q04741 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMX1Q04741 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EMX1Q04741 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMX1Q04741 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMX1Q04741 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EMX1Q04741 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMX1Q04741 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMX1Q04741 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EMX1Q04741 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMX1Q04741 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMX1Q04741 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EMX1Q04741 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMX1Q04741 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMX1Q04741 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
EMX1Q04741 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMX1Q04741 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMX1Q04741 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMX1Q04741 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMX1Q04741 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMX1Q04741 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EMX1Q04741 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMX1Q04741 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMX1Q04741 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EMX1Q04741 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EMX1Q04741 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EMX1Q04741 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMX1Q04741 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EMX1Q04741 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EMX1Q04741 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EMX1Q04741 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMX1Q04741 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMX1Q04741 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMX1Q04741 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMX1Q04741 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMX1Q04741 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMX1Q04741 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMX1Q04741 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMX1Q04741 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMX1Q04741 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMX1Q04741 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMX1Q04741 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMX1Q04741 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMX1Q04741 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMX1Q04741 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMX1Q04741 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMX1Q04741 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMX1Q04741 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMX1Q04741 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms