Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 CAB5YDR196C 726 nt12.03□□□□□ -0.48
SYF1Q04048 PEX2YJL210W 816 nt12.02□□□□□ -0.49
SYF1Q04048 YGR012WYGR012W 1182 nt12.01□□□□□ -0.49
SYF1Q04048 TSC10YBR265W 963 nt12.01□□□□□ -0.49
SYF1Q04048 RIB3YDR487C 627 nt11.99□□□□□ -0.49
SYF1Q04048 HIP1YGR191W 1812 nt11.98□□□□□ -0.49
SYF1Q04048 NRT1YOR071C 1797 nt11.98□□□□□ -0.49
SYF1Q04048 YLR349WYLR349W 507 nt11.97□□□□□ -0.49
SYF1Q04048 POM34YLR018C 900 nt11.95□□□□□ -0.5
SYF1Q04048 FUN14YAL008W 597 nt11.94□□□□□ -0.5
SYF1Q04048 ADH7YCR105W 1086 nt11.93□□□□□ -0.5
SYF1Q04048 YJL195CYJL195C 702 nt11.93□□□□□ -0.5
SYF1Q04048 PAU15YIR041W 375 nt11.92□□□□□ -0.5
SYF1Q04048 DUS1YML080W 1272 nt11.92□□□□□ -0.5
SYF1Q04048 AQY2YLL052C 450 nt11.91□□□□□ -0.5
SYF1Q04048 YLR279WYLR279W 390 nt11.91□□□□□ -0.5
SYF1Q04048 PRO1YDR300C 1287 nt11.9□□□□□ -0.5
SYF1Q04048 YML089CYML089C 369 nt11.9□□□□□ -0.5
SYF1Q04048 MET28YIR017C 564 nt11.89□□□□□ -0.51
SYF1Q04048 TIF6YPR016C 738 nt11.86□□□□□ -0.51
SYF1Q04048 STR3YGL184C 1398 nt11.86□□□□□ -0.51
SYF1Q04048 SWE1YJL187C 2460 nt11.86□□□□□ -0.51
SYF1Q04048 LSC2YGR244C 1284 nt11.85□□□□□ -0.51
SYF1Q04048 ATG15YCR068W 1563 nt11.84□□□□□ -0.51
SYF1Q04048 ADH1YOL086C 1047 nt11.84□□□□□ -0.51
SYF1Q04048 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt11.84□□□□□ -0.51
SYF1Q04048 MSB4YOL112W 1479 nt11.82□□□□□ -0.52
SYF1Q04048 GPN2YOR262W 1044 nt11.8□□□□□ -0.52
SYF1Q04048 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.78□□□□□ -0.52
SYF1Q04048 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.78□□□□□ -0.52
SYF1Q04048 YPI1YFR003C 468 nt11.76□□□□□ -0.53
SYF1Q04048 FIT3YOR383C 615 nt11.75□□□□□ -0.53
SYF1Q04048 YCL074WYCL074W 927 nt11.72□□□□□ -0.53
SYF1Q04048 YEL008WYEL008W 381 nt11.72□□□□□ -0.53
SYF1Q04048 LOT5YKL183W 921 nt11.7□□□□□ -0.54
SYF1Q04048 GND1YHR183W 1470 nt11.7□□□□□ -0.54
SYF1Q04048 CPD1YGR247W 720 nt11.69□□□□□ -0.54
SYF1Q04048 AAC1YMR056C 930 nt11.69□□□□□ -0.54
SYF1Q04048 GAP1YKR039W 1809 nt11.67□□□□□ -0.54
SYF1Q04048 ARP6YLR085C 1317 nt11.67□□□□□ -0.54
SYF1Q04048 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt11.67□□□□□ -0.54
SYF1Q04048 ESS1YJR017C 513 nt11.65□□□□□ -0.54
SYF1Q04048 APT2YDR441C 546 nt11.64□□□□□ -0.55
SYF1Q04048 UME6YDR207C 2511 nt11.59□□□□□ -0.55
SYF1Q04048 SMM1YNR015W 1155 nt11.57□□□□□ -0.56
SYF1Q04048 ALP1YNL270C 1722 nt11.56□□□□□ -0.56
SYF1Q04048 PLB1YMR008C 1995 nt11.56□□□□□ -0.56
SYF1Q04048 ZTA1YBR046C 1005 nt11.55□□□□□ -0.56
SYF1Q04048 YAR028WYAR028W 705 nt11.53□□□□□ -0.56
SYF1Q04048 AKR2YOR034C 2250 nt11.52□□□□□ -0.57
SYF1Q04048 RTN2YDL204W 1182 nt11.51□□□□□ -0.57
SYF1Q04048 DIF1YLR437C 402 nt11.51□□□□□ -0.57
SYF1Q04048 RIB2YOL066C 1776 nt11.51□□□□□ -0.57
SYF1Q04048 LSB3YFR024C-A 1380 nt11.5□□□□□ -0.57
SYF1Q04048 MTG2YHR168W 1557 nt11.49□□□□□ -0.57
SYF1Q04048 SEN2YLR105C 1134 nt11.48□□□□□ -0.57
SYF1Q04048 FCY21YER060W 1587 nt11.45□□□□□ -0.58
SYF1Q04048 NAP1YKR048C 1254 nt11.44□□□□□ -0.58
SYF1Q04048 FUR4YBR021W 1902 nt11.43□□□□□ -0.58
SYF1Q04048 UTR1YJR049C 1593 nt11.41□□□□□ -0.58
SYF1Q04048 PUP1YOR157C 786 nt11.41□□□□□ -0.58
SYF1Q04048 VRG4YGL225W 1014 nt11.38□□□□□ -0.59
SYF1Q04048 PAU5YFL020C 369 nt11.37□□□□□ -0.59
SYF1Q04048 PRY1YJL079C 900 nt11.37□□□□□ -0.59
SYF1Q04048 HXT12YIL170W 1374 nt11.36□□□□□ -0.59
SYF1Q04048 PGC1YPL206C 966 nt11.35□□□□□ -0.59
SYF1Q04048 ALD4YOR374W 1560 nt11.33□□□□□ -0.6
SYF1Q04048 UGA4YDL210W 1716 nt11.32□□□□□ -0.6
SYF1Q04048 YER190C-AYER190C-A 576 nt11.31□□□□□ -0.6
SYF1Q04048 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt11.31□□□□□ -0.6
SYF1Q04048 YJL055WYJL055W 738 nt11.31□□□□□ -0.6
SYF1Q04048 YML133W-AYML133W-A 576 nt11.31□□□□□ -0.6
SYF1Q04048 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt11.31□□□□□ -0.6
SYF1Q04048 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt11.31□□□□□ -0.6
SYF1Q04048 YGR259CYGR259C 441 nt11.3□□□□□ -0.6
SYF1Q04048 YBR232CYBR232C 360 nt11.3□□□□□ -0.6
SYF1Q04048 STP3YLR375W 1032 nt11.28□□□□□ -0.6
SYF1Q04048 SED1YDR077W 1017 nt11.27□□□□□ -0.61
SYF1Q04048 YKR005CYKR005C 1578 nt11.26□□□□□ -0.61
SYF1Q04048 SAM35YHR083W 990 nt11.26□□□□□ -0.61
SYF1Q04048 YJL064WYJL064W 396 nt11.26□□□□□ -0.61
SYF1Q04048 CCT5YJR064W 1689 nt11.24□□□□□ -0.61
SYF1Q04048 LIP1YMR298W 453 nt11.2□□□□□ -0.62
SYF1Q04048 PRM5YIL117C 957 nt11.19□□□□□ -0.62
SYF1Q04048 PAU19YMR325W 375 nt11.18□□□□□ -0.62
SYF1Q04048 TAF13YML098W 504 nt11.15□□□□□ -0.62
SYF1Q04048 SLG1YOR008C 1137 nt11.14□□□□□ -0.63
SYF1Q04048 HSP60YLR259C 1719 nt11.14□□□□□ -0.63
SYF1Q04048 THI72YOR192C 1800 nt11.14□□□□□ -0.63
SYF1Q04048 CSM1YCR086W 573 nt11.13□□□□□ -0.63
SYF1Q04048 YPL251WYPL251W 303 nt11.13□□□□□ -0.63
SYF1Q04048 MEP3YPR138C 1470 nt11.12□□□□□ -0.63
SYF1Q04048 TIM44YIL022W 1296 nt11.12□□□□□ -0.63
SYF1Q04048 YMR103CYMR103C 363 nt11.12□□□□□ -0.63
SYF1Q04048 LSB5YCL034W 1065 nt11.12□□□□□ -0.63
SYF1Q04048 YJL225CYJL225C 5277 nt11.11□□□□□ -0.63
SYF1Q04048 PRP4YPR178W 1398 nt11.11□□□□□ -0.63
SYF1Q04048 BRR1YPR057W 1026 nt11.1□□□□□ -0.63
SYF1Q04048 YJL118WYJL118W 660 nt11.08□□□□□ -0.64
SYF1Q04048 TOA2YKL058W 369 nt11.08□□□□□ -0.64
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