Protein–RNA interactions for Protein: P63027

VAMP2, Vesicle-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP2P63027 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP2P63027 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP2P63027 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAMP2P63027 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAMP2P63027 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAMP2P63027 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAMP2P63027 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VAMP2P63027 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAMP2P63027 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VAMP2P63027 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VAMP2P63027 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAMP2P63027 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VAMP2P63027 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP2P63027 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VAMP2P63027 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VAMP2P63027 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAMP2P63027 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VAMP2P63027 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAMP2P63027 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAMP2P63027 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAMP2P63027 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAMP2P63027 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAMP2P63027 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAMP2P63027 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAMP2P63027 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAMP2P63027 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAMP2P63027 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAMP2P63027 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAMP2P63027 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAMP2P63027 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP2P63027 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP2P63027 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP2P63027 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP2P63027 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAMP2P63027 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
VAMP2P63027 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VAMP2P63027 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
VAMP2P63027 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAMP2P63027 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAMP2P63027 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAMP2P63027 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAMP2P63027 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAMP2P63027 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAMP2P63027 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAMP2P63027 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAMP2P63027 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VAMP2P63027 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAMP2P63027 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAMP2P63027 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VAMP2P63027 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAMP2P63027 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VAMP2P63027 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAMP2P63027 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAMP2P63027 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VAMP2P63027 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VAMP2P63027 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
VAMP2P63027 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
VAMP2P63027 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
VAMP2P63027 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAMP2P63027 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAMP2P63027 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAMP2P63027 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAMP2P63027 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
VAMP2P63027 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAMP2P63027 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAMP2P63027 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAMP2P63027 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms