Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VSNL1P62760 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
VSNL1P62760 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VSNL1P62760 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
VSNL1P62760 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VSNL1P62760 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
VSNL1P62760 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
VSNL1P62760 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
VSNL1P62760 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VSNL1P62760 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VSNL1P62760 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
VSNL1P62760 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VSNL1P62760 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VSNL1P62760 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VSNL1P62760 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VSNL1P62760 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VSNL1P62760 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VSNL1P62760 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
VSNL1P62760 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VSNL1P62760 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VSNL1P62760 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VSNL1P62760 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VSNL1P62760 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
VSNL1P62760 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VSNL1P62760 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VSNL1P62760 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
VSNL1P62760 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VSNL1P62760 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VSNL1P62760 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
VSNL1P62760 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
VSNL1P62760 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
VSNL1P62760 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VSNL1P62760 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VSNL1P62760 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VSNL1P62760 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VSNL1P62760 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VSNL1P62760 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
VSNL1P62760 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VSNL1P62760 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VSNL1P62760 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VSNL1P62760 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VSNL1P62760 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VSNL1P62760 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VSNL1P62760 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VSNL1P62760 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VSNL1P62760 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VSNL1P62760 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VSNL1P62760 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VSNL1P62760 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VSNL1P62760 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSNL1P62760 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VSNL1P62760 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSNL1P62760 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VSNL1P62760 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VSNL1P62760 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VSNL1P62760 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VSNL1P62760 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VSNL1P62760 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VSNL1P62760 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VSNL1P62760 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VSNL1P62760 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VSNL1P62760 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VSNL1P62760 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
VSNL1P62760 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
VSNL1P62760 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VSNL1P62760 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
VSNL1P62760 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VSNL1P62760 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VSNL1P62760 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VSNL1P62760 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VSNL1P62760 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VSNL1P62760 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
VSNL1P62760 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VSNL1P62760 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
VSNL1P62760 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
VSNL1P62760 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VSNL1P62760 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
VSNL1P62760 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
VSNL1P62760 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VSNL1P62760 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
VSNL1P62760 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
VSNL1P62760 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VSNL1P62760 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
VSNL1P62760 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms