Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NKX2-5P52952 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-5P52952 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NKX2-5P52952 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NKX2-5P52952 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NKX2-5P52952 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-5P52952 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-5P52952 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NKX2-5P52952 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX2-5P52952 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NKX2-5P52952 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-5P52952 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NKX2-5P52952 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX2-5P52952 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NKX2-5P52952 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-5P52952 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NKX2-5P52952 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX2-5P52952 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX2-5P52952 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NKX2-5P52952 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NKX2-5P52952 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-5P52952 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NKX2-5P52952 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-5P52952 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-5P52952 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-5P52952 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-5P52952 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NKX2-5P52952 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX2-5P52952 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX2-5P52952 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NKX2-5P52952 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-5P52952 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-5P52952 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NKX2-5P52952 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NKX2-5P52952 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NKX2-5P52952 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms