Protein–RNA interactions for Protein: P51684

CCR6, C-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6P51684 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR6P51684 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR6P51684 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCR6P51684 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR6P51684 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR6P51684 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR6P51684 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCR6P51684 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR6P51684 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR6P51684 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR6P51684 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCR6P51684 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR6P51684 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR6P51684 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCR6P51684 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR6P51684 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCR6P51684 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR6P51684 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCR6P51684 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCR6P51684 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR6P51684 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCR6P51684 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR6P51684 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCR6P51684 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCR6P51684 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCR6P51684 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCR6P51684 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR6P51684 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCR6P51684 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR6P51684 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCR6P51684 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR6P51684 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCR6P51684 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCR6P51684 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCR6P51684 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR6P51684 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCR6P51684 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCR6P51684 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCR6P51684 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR6P51684 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCR6P51684 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR6P51684 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR6P51684 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR6P51684 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR6P51684 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCR6P51684 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR6P51684 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR6P51684 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR6P51684 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCR6P51684 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCR6P51684 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCR6P51684 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCR6P51684 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCR6P51684 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCR6P51684 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCR6P51684 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCR6P51684 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR6P51684 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR6P51684 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR6P51684 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR6P51684 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR6P51684 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCR6P51684 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR6P51684 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR6P51684 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR6P51684 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR6P51684 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR6P51684 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCR6P51684 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR6P51684 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCR6P51684 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR6P51684 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCR6P51684 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR6P51684 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR6P51684 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR6P51684 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR6P51684 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR6P51684 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCR6P51684 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR6P51684 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCR6P51684 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR6P51684 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR6P51684 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR6P51684 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR6P51684 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCR6P51684 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCR6P51684 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCR6P51684 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR6P51684 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR6P51684 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCR6P51684 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR6P51684 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR6P51684 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR6P51684 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR6P51684 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR6P51684 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCR6P51684 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR6P51684 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR6P51684 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCR6P51684 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms