Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX2P48378 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX2P48378 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX2P48378 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFX2P48378 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX2P48378 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFX2P48378 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX2P48378 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFX2P48378 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFX2P48378 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX2P48378 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RFX2P48378 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX2P48378 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RFX2P48378 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RFX2P48378 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX2P48378 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RFX2P48378 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RFX2P48378 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RFX2P48378 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX2P48378 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX2P48378 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RFX2P48378 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX2P48378 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX2P48378 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RFX2P48378 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX2P48378 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX2P48378 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RFX2P48378 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX2P48378 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RFX2P48378 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RFX2P48378 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX2P48378 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX2P48378 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RFX2P48378 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX2P48378 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RFX2P48378 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX2P48378 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX2P48378 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RFX2P48378 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX2P48378 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX2P48378 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RFX2P48378 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX2P48378 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX2P48378 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RFX2P48378 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX2P48378 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX2P48378 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RFX2P48378 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX2P48378 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX2P48378 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX2P48378 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RFX2P48378 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX2P48378 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX2P48378 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX2P48378 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RFX2P48378 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RFX2P48378 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX2P48378 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX2P48378 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX2P48378 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RFX2P48378 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX2P48378 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX2P48378 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX2P48378 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RFX2P48378 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
RFX2P48378 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX2P48378 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RFX2P48378 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RFX2P48378 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX2P48378 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RFX2P48378 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX2P48378 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX2P48378 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX2P48378 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RFX2P48378 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX2P48378 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RFX2P48378 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX2P48378 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RFX2P48378 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX2P48378 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX2P48378 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RFX2P48378 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX2P48378 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX2P48378 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RFX2P48378 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX2P48378 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX2P48378 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX2P48378 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RFX2P48378 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RFX2P48378 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX2P48378 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RFX2P48378 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX2P48378 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RFX2P48378 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX2P48378 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RFX2P48378 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX2P48378 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RFX2P48378 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX2P48378 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RFX2P48378 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms