Protein–RNA interactions for Protein: P42826

XKS1, Xylulose kinase, yeastyeast

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
XKS1P42826 CCA1YER168C 1641 nt12.84□□□□□ -0.35
XKS1P42826 RIB3YDR487C 627 nt12.83□□□□□ -0.36
XKS1P42826 TSC10YBR265W 963 nt12.83□□□□□ -0.36
XKS1P42826 FUN14YAL008W 597 nt12.82□□□□□ -0.36
XKS1P42826 PEX2YJL210W 816 nt12.82□□□□□ -0.36
XKS1P42826 ADH7YCR105W 1086 nt12.81□□□□□ -0.36
XKS1P42826 YLR279WYLR279W 390 nt12.81□□□□□ -0.36
XKS1P42826 HIP1YGR191W 1812 nt12.81□□□□□ -0.36
XKS1P42826 PAU15YIR041W 375 nt12.78□□□□□ -0.36
XKS1P42826 YJL195CYJL195C 702 nt12.77□□□□□ -0.37
XKS1P42826 POM34YLR018C 900 nt12.77□□□□□ -0.37
XKS1P42826 NRT1YOR071C 1797 nt12.76□□□□□ -0.37
XKS1P42826 PRO1YDR300C 1287 nt12.69□□□□□ -0.38
XKS1P42826 ADH1YOL086C 1047 nt12.69□□□□□ -0.38
XKS1P42826 YML089CYML089C 369 nt12.68□□□□□ -0.38
XKS1P42826 TIF6YPR016C 738 nt12.68□□□□□ -0.38
XKS1P42826 MSB4YOL112W 1479 nt12.66□□□□□ -0.38
XKS1P42826 MET28YIR017C 564 nt12.66□□□□□ -0.38
XKS1P42826 GPN2YOR262W 1044 nt12.64□□□□□ -0.39
XKS1P42826 STR3YGL184C 1398 nt12.62□□□□□ -0.39
XKS1P42826 LSC2YGR244C 1284 nt12.62□□□□□ -0.39
XKS1P42826 AQY2YLL052C 450 nt12.62□□□□□ -0.39
XKS1P42826 DUS1YML080W 1272 nt12.62□□□□□ -0.39
XKS1P42826 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt12.61□□□□□ -0.39
XKS1P42826 SWE1YJL187C 2460 nt12.61□□□□□ -0.39
XKS1P42826 ATG15YCR068W 1563 nt12.6□□□□□ -0.39
XKS1P42826 YPI1YFR003C 468 nt12.58□□□□□ -0.4
XKS1P42826 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.56□□□□□ -0.4
XKS1P42826 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.56□□□□□ -0.4
XKS1P42826 YEL008WYEL008W 381 nt12.56□□□□□ -0.4
XKS1P42826 ESS1YJR017C 513 nt12.54□□□□□ -0.4
XKS1P42826 CPD1YGR247W 720 nt12.53□□□□□ -0.4
XKS1P42826 FIT3YOR383C 615 nt12.53□□□□□ -0.4
XKS1P42826 LOT5YKL183W 921 nt12.52□□□□□ -0.41
XKS1P42826 AAC1YMR056C 930 nt12.52□□□□□ -0.41
XKS1P42826 GND1YHR183W 1470 nt12.51□□□□□ -0.41
XKS1P42826 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt12.49□□□□□ -0.41
XKS1P42826 ARP6YLR085C 1317 nt12.45□□□□□ -0.42
XKS1P42826 YCL074WYCL074W 927 nt12.44□□□□□ -0.42
XKS1P42826 GAP1YKR039W 1809 nt12.42□□□□□ -0.42
XKS1P42826 APT2YDR441C 546 nt12.42□□□□□ -0.42
XKS1P42826 ZTA1YBR046C 1005 nt12.37□□□□□ -0.43
XKS1P42826 SMM1YNR015W 1155 nt12.35□□□□□ -0.43
XKS1P42826 SEN2YLR105C 1134 nt12.33□□□□□ -0.44
XKS1P42826 PUP1YOR157C 786 nt12.33□□□□□ -0.44
XKS1P42826 RIB2YOL066C 1776 nt12.3□□□□□ -0.44
XKS1P42826 YAR028WYAR028W 705 nt12.3□□□□□ -0.44
XKS1P42826 ALP1YNL270C 1722 nt12.3□□□□□ -0.44
XKS1P42826 PLB1YMR008C 1995 nt12.3□□□□□ -0.44
XKS1P42826 AKR2YOR034C 2250 nt12.29□□□□□ -0.44
XKS1P42826 NAP1YKR048C 1254 nt12.29□□□□□ -0.44
XKS1P42826 DIF1YLR437C 402 nt12.29□□□□□ -0.44
XKS1P42826 LSB3YFR024C-A 1380 nt12.29□□□□□ -0.44
XKS1P42826 MTG2YHR168W 1557 nt12.27□□□□□ -0.44
XKS1P42826 RTN2YDL204W 1182 nt12.27□□□□□ -0.45
XKS1P42826 FCY21YER060W 1587 nt12.26□□□□□ -0.45
XKS1P42826 PGC1YPL206C 966 nt12.23□□□□□ -0.45
XKS1P42826 PAC11YDR488C 1602 nt12.19□□□□□ -0.46
XKS1P42826 PAU5YFL020C 369 nt12.19□□□□□ -0.46
XKS1P42826 HXT12YIL170W 1374 nt12.18□□□□□ -0.46
XKS1P42826 YBR232CYBR232C 360 nt12.18□□□□□ -0.46
XKS1P42826 PRY1YJL079C 900 nt12.17□□□□□ -0.46
XKS1P42826 UTR1YJR049C 1593 nt12.16□□□□□ -0.46
XKS1P42826 ALD4YOR374W 1560 nt12.15□□□□□ -0.46
XKS1P42826 FUR4YBR021W 1902 nt12.14□□□□□ -0.47
XKS1P42826 VRG4YGL225W 1014 nt12.13□□□□□ -0.47
XKS1P42826 UGA4YDL210W 1716 nt12.12□□□□□ -0.47
XKS1P42826 YJL064WYJL064W 396 nt12.11□□□□□ -0.47
XKS1P42826 YJL055WYJL055W 738 nt12.09□□□□□ -0.47
XKS1P42826 STP3YLR375W 1032 nt12.09□□□□□ -0.47
XKS1P42826 YER190C-AYER190C-A 576 nt12.06□□□□□ -0.48
XKS1P42826 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt12.06□□□□□ -0.48
XKS1P42826 YML133W-AYML133W-A 576 nt12.06□□□□□ -0.48
XKS1P42826 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt12.06□□□□□ -0.48
XKS1P42826 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt12.06□□□□□ -0.48
XKS1P42826 NVJ2YPR091C 2313 nt12.06□□□□□ -0.48
XKS1P42826 PAU19YMR325W 375 nt12.05□□□□□ -0.48
XKS1P42826 CCT5YJR064W 1689 nt12.03□□□□□ -0.48
XKS1P42826 SED1YDR077W 1017 nt12.01□□□□□ -0.49
XKS1P42826 SLG1YOR008C 1137 nt11.99□□□□□ -0.49
XKS1P42826 YGR259CYGR259C 441 nt11.97□□□□□ -0.49
XKS1P42826 YJR114WYJR114W 393 nt11.97□□□□□ -0.49
XKS1P42826 TIM44YIL022W 1296 nt11.96□□□□□ -0.49
XKS1P42826 YKR005CYKR005C 1578 nt11.95□□□□□ -0.5
XKS1P42826 CSM1YCR086W 573 nt11.92□□□□□ -0.5
XKS1P42826 SAM35YHR083W 990 nt11.92□□□□□ -0.5
XKS1P42826 PRM5YIL117C 957 nt11.92□□□□□ -0.5
XKS1P42826 YPL251WYPL251W 303 nt11.92□□□□□ -0.5
XKS1P42826 THI72YOR192C 1800 nt11.91□□□□□ -0.5
XKS1P42826 LIP1YMR298W 453 nt11.91□□□□□ -0.5
XKS1P42826 HSP60YLR259C 1719 nt11.89□□□□□ -0.51
XKS1P42826 TAF13YML098W 504 nt11.88□□□□□ -0.51
XKS1P42826 GAL3YDR009W 1563 nt11.87□□□□□ -0.51
XKS1P42826 MEP3YPR138C 1470 nt11.86□□□□□ -0.51
XKS1P42826 YJL118WYJL118W 660 nt11.85□□□□□ -0.51
XKS1P42826 YMR103CYMR103C 363 nt11.84□□□□□ -0.51
XKS1P42826 TIP1YBR067C 633 nt11.84□□□□□ -0.51
XKS1P42826 YMR262WYMR262W 942 nt11.83□□□□□ -0.52
XKS1P42826 LSB5YCL034W 1065 nt11.83□□□□□ -0.52
XKS1P42826 NME1NME1 340 nt11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.5 ms