Protein–RNA interactions for Protein: P38316

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, yeast

Predictions only

Length 186 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	P38316	AAC1	YMR056C	930 nt		10.3	□□□□□ -0.76
ATG12	P38316	RPL4A	YBR031W	1089 nt		10.3	□□□□□ -0.76
ATG12	P38316	CLB6	YGR109C	1143 nt		10.29	□□□□□ -0.76
ATG12	P38316	BMT6	YLR063W	1098 nt		10.28	□□□□□ -0.76
ATG12	P38316	SNF1	YDR477W	1902 nt		10.25	□□□□□ -0.77
ATG12	P38316	TIR3	YIL011W	810 nt		10.24	□□□□□ -0.77
ATG12	P38316	SDH5	YOL071W	489 nt		10.24	□□□□□ -0.77
ATG12	P38316	NBP35	YGL091C	987 nt		10.23	□□□□□ -0.77
ATG12	P38316	SAM1	YLR180W	1149 nt		10.21	□□□□□ -0.77
ATG12	P38316	UTH1	YKR042W	1098 nt		10.2	□□□□□ -0.78
ATG12	P38316	RPS14B	YJL191W	417 nt		10.19	□□□□□ -0.78
ATG12	P38316	SHH4	YLR164W	507 nt		10.18	□□□□□ -0.78
ATG12	P38316	UME6	YDR207C	2511 nt		10.17	□□□□□ -0.78
ATG12	P38316	IRC24	YIR036C	792 nt		10.17	□□□□□ -0.78
ATG12	P38316	TOM6	YOR045W	186 nt		10.17	□□□□□ -0.78
ATG12	P38316	BIO5	YNR056C	1686 nt		10.17	□□□□□ -0.78
ATG12	P38316	RDN37-1	RDN37-1	5354 nt		10.17	□□□□□ -0.78
ATG12	P38316	RDN37-2	RDN37-2	5354 nt		10.17	□□□□□ -0.78
ATG12	P38316	RAD23	YEL037C	1197 nt		10.15	□□□□□ -0.78
ATG12	P38316	YML089C	YML089C	369 nt		10.15	□□□□□ -0.78
ATG12	P38316	PEX2	YJL210W	816 nt		10.14	□□□□□ -0.79
ATG12	P38316	RTN2	YDL204W	1182 nt		10.13	□□□□□ -0.79
ATG12	P38316	POM34	YLR018C	900 nt		10.13	□□□□□ -0.79
ATG12	P38316	LSC2	YGR244C	1284 nt		10.12	□□□□□ -0.79
ATG12	P38316	TSC10	YBR265W	963 nt		10.12	□□□□□ -0.79
ATG12	P38316	HIP1	YGR191W	1812 nt		10.12	□□□□□ -0.79
ATG12	P38316	NRT1	YOR071C	1797 nt		10.11	□□□□□ -0.79
ATG12	P38316	MCH5	YOR306C	1566 nt		10.11	□□□□□ -0.79
ATG12	P38316	PRO1	YDR300C	1287 nt		10.09	□□□□□ -0.79
ATG12	P38316	MET28	YIR017C	564 nt		10.08	□□□□□ -0.8
ATG12	P38316	YGR012W	YGR012W	1182 nt		10.07	□□□□□ -0.8
ATG12	P38316	ATG15	YCR068W	1563 nt		10.06	□□□□□ -0.8
ATG12	P38316	NAR1	YNL240C	1476 nt		10.05	□□□□□ -0.8
ATG12	P38316	PLB1	YMR008C	1995 nt		10.05	□□□□□ -0.8
ATG12	P38316	ARP6	YLR085C	1317 nt		10.04	□□□□□ -0.8
ATG12	P38316	RIB3	YDR487C	627 nt		10.03	□□□□□ -0.8
ATG12	P38316	YLR437C-A	YLR437C-A	228 nt		10.03	□□□□□ -0.8
ATG12	P38316	TIF6	YPR016C	738 nt		10.03	□□□□□ -0.8
ATG12	P38316	PBP1	YGR178C	2169 nt		10.01	□□□□□ -0.81
ATG12	P38316	FIT3	YOR383C	615 nt		9.99	□□□□□ -0.81
ATG12	P38316	YLR279W	YLR279W	390 nt		9.97	□□□□□ -0.81
ATG12	P38316	GAP1	YKR039W	1809 nt		9.96	□□□□□ -0.82
ATG12	P38316	YPL222C-A	YPL222C-A	246 nt		9.95	□□□□□ -0.82
ATG12	P38316	CAB5	YDR196C	726 nt		9.93	□□□□□ -0.82
ATG12	P38316	PRM5	YIL117C	957 nt		9.93	□□□□□ -0.82
ATG12	P38316	CYT2	YKL087C	675 nt		9.93	□□□□□ -0.82
ATG12	P38316	UTR1	YJR049C	1593 nt		9.9	□□□□□ -0.82
ATG12	P38316	STE4	YOR212W	1272 nt		9.9	□□□□□ -0.82
ATG12	P38316	MSB4	YOL112W	1479 nt		9.9	□□□□□ -0.83
ATG12	P38316	YJL195C	YJL195C	702 nt		9.88	□□□□□ -0.83
ATG12	P38316	RAD51	YER095W	1203 nt		9.87	□□□□□ -0.83
ATG12	P38316	FUN14	YAL008W	597 nt		9.87	□□□□□ -0.83
ATG12	P38316	YPI1	YFR003C	468 nt		9.85	□□□□□ -0.83
ATG12	P38316	HIF1	YLL022C	1158 nt		9.85	□□□□□ -0.83
ATG12	P38316	ALD4	YOR374W	1560 nt		9.83	□□□□□ -0.84
ATG12	P38316	YAR028W	YAR028W	705 nt		9.82	□□□□□ -0.84
ATG12	P38316	ADH1	YOL086C	1047 nt		9.82	□□□□□ -0.84
ATG12	P38316	ALP1	YNL270C	1722 nt		9.82	□□□□□ -0.84
ATG12	P38316	GND1	YHR183W	1470 nt		9.81	□□□□□ -0.84
ATG12	P38316	LOT5	YKL183W	921 nt		9.81	□□□□□ -0.84
ATG12	P38316	YLR349W	YLR349W	507 nt		9.81	□□□□□ -0.84
ATG12	P38316	YNR029C	YNR029C	1290 nt		9.81	□□□□□ -0.84
ATG12	P38316	DIF1	YLR437C	402 nt		9.8	□□□□□ -0.84
ATG12	P38316	ADH7	YCR105W	1086 nt		9.79	□□□□□ -0.84
ATG12	P38316	RPM1	RPM1	483 nt		9.77	□□□□□ -0.85
ATG12	P38316	AKR2	YOR034C	2250 nt		9.77	□□□□□ -0.85
ATG12	P38316	YAT1	YAR035W	2064 nt		9.76	□□□□□ -0.85
ATG12	P38316	PAU15	YIR041W	375 nt		9.76	□□□□□ -0.85
ATG12	P38316	MTG2	YHR168W	1557 nt		9.74	□□□□□ -0.85
ATG12	P38316	SAM35	YHR083W	990 nt		9.73	□□□□□ -0.85
ATG12	P38316	ZTA1	YBR046C	1005 nt		9.73	□□□□□ -0.85
ATG12	P38316	YEL008W	YEL008W	381 nt		9.72	□□□□□ -0.85
ATG12	P38316	APT2	YDR441C	546 nt		9.71	□□□□□ -0.86
ATG12	P38316	SMM1	YNR015W	1155 nt		9.71	□□□□□ -0.86
ATG12	P38316	GPN2	YOR262W	1044 nt		9.7	□□□□□ -0.86
ATG12	P38316	LSB3	YFR024C-A	1380 nt		9.66	□□□□□ -0.86
ATG12	P38316	CPD1	YGR247W	720 nt		9.66	□□□□□ -0.86
ATG12	P38316	FCY21	YER060W	1587 nt		9.66	□□□□□ -0.86
ATG12	P38316	SED1	YDR077W	1017 nt		9.64	□□□□□ -0.87
ATG12	P38316	DBP1	YPL119C	1854 nt		9.64	□□□□□ -0.87
ATG12	P38316	YER190C-A	YER190C-A	576 nt		9.61	□□□□□ -0.87
ATG12	P38316	YGR296C-A	YGR296C-A	576 nt		9.61	□□□□□ -0.87
ATG12	P38316	YML133W-A	YML133W-A	576 nt		9.61	□□□□□ -0.87
ATG12	P38316	YNL339W-A	YNL339W-A	576 nt		9.61	□□□□□ -0.87
ATG12	P38316	YPL283W-A	YPL283W-A	576 nt		9.61	□□□□□ -0.87
ATG12	P38316	HXT1	YHR094C	1713 nt		9.61	□□□□□ -0.87
ATG12	P38316	CMP2	YML057W	1815 nt		9.61	□□□□□ -0.87
ATG12	P38316	tS(GCU)L	tS(GCU)L	80 nt		9.6	□□□□□ -0.87
ATG12	P38316	ZRT3	YKL175W	1512 nt		9.6	□□□□□ -0.87
ATG12	P38316	RIB2	YOL066C	1776 nt		9.6	□□□□□ -0.87
ATG12	P38316	PRY1	YJL079C	900 nt		9.58	□□□□□ -0.88
ATG12	P38316	LIP1	YMR298W	453 nt		9.58	□□□□□ -0.88
ATG12	P38316	RPC82	YPR190C	1965 nt		9.57	□□□□□ -0.88
ATG12	P38316	VRG4	YGL225W	1014 nt		9.56	□□□□□ -0.88
ATG12	P38316	INA1	YLR413W	2028 nt		9.55	□□□□□ -0.88
ATG12	P38316	SHY1	YGR112W	1170 nt		9.55	□□□□□ -0.88
ATG12	P38316	ESS1	YJR017C	513 nt		9.55	□□□□□ -0.88
ATG12	P38316	YBL086C	YBL086C	1401 nt		9.55	□□□□□ -0.88
ATG12	P38316	UGA4	YDL210W	1716 nt		9.54	□□□□□ -0.88
ATG12	P38316	HXT12	YIL170W	1374 nt		9.54	□□□□□ -0.88

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