Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2IP36954 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2IP36954 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR2IP36954 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2IP36954 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR2IP36954 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR2IP36954 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR2IP36954 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR2IP36954 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2IP36954 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2IP36954 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR2IP36954 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR2IP36954 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2IP36954 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2IP36954 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2IP36954 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2IP36954 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2IP36954 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2IP36954 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2IP36954 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2IP36954 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2IP36954 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2IP36954 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2IP36954 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2IP36954 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2IP36954 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2IP36954 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2IP36954 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2IP36954 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2IP36954 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2IP36954 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLR2IP36954 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2IP36954 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2IP36954 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2IP36954 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2IP36954 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
POLR2IP36954 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
POLR2IP36954 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
POLR2IP36954 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2IP36954 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2IP36954 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
POLR2IP36954 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
POLR2IP36954 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2IP36954 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
POLR2IP36954 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2IP36954 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2IP36954 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2IP36954 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
POLR2IP36954 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2IP36954 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
POLR2IP36954 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2IP36954 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
POLR2IP36954 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
POLR2IP36954 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2IP36954 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
POLR2IP36954 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2IP36954 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2IP36954 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
POLR2IP36954 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
POLR2IP36954 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2IP36954 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
POLR2IP36954 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2IP36954 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2IP36954 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
POLR2IP36954 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2IP36954 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
POLR2IP36954 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2IP36954 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
POLR2IP36954 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
POLR2IP36954 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
POLR2IP36954 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
POLR2IP36954 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
POLR2IP36954 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
POLR2IP36954 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2IP36954 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2IP36954 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
POLR2IP36954 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2IP36954 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2IP36954 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2IP36954 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
POLR2IP36954 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2IP36954 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
POLR2IP36954 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
POLR2IP36954 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms