Protein–RNA interactions for Protein: P35712

SOX6, Transcription factor SOX-6, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX6P35712 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX6P35712 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX6P35712 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SOX6P35712 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX6P35712 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX6P35712 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX6P35712 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX6P35712 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX6P35712 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SOX6P35712 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX6P35712 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SOX6P35712 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX6P35712 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX6P35712 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SOX6P35712 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SOX6P35712 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SOX6P35712 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX6P35712 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX6P35712 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SOX6P35712 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX6P35712 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SOX6P35712 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX6P35712 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX6P35712 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SOX6P35712 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX6P35712 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX6P35712 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SOX6P35712 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX6P35712 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX6P35712 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SOX6P35712 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SOX6P35712 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX6P35712 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SOX6P35712 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX6P35712 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX6P35712 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SOX6P35712 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX6P35712 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SOX6P35712 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX6P35712 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX6P35712 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SOX6P35712 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SOX6P35712 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX6P35712 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX6P35712 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SOX6P35712 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX6P35712 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX6P35712 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX6P35712 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SOX6P35712 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX6P35712 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX6P35712 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX6P35712 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SOX6P35712 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX6P35712 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX6P35712 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SOX6P35712 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX6P35712 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX6P35712 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX6P35712 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX6P35712 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SOX6P35712 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX6P35712 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX6P35712 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX6P35712 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SOX6P35712 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SOX6P35712 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX6P35712 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SOX6P35712 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX6P35712 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SOX6P35712 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX6P35712 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SOX6P35712 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX6P35712 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX6P35712 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX6P35712 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX6P35712 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SOX6P35712 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SOX6P35712 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX6P35712 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX6P35712 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX6P35712 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SOX6P35712 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SOX6P35712 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX6P35712 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX6P35712 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SOX6P35712 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX6P35712 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX6P35712 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX6P35712 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SOX6P35712 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SOX6P35712 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SOX6P35712 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SOX6P35712 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX6P35712 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX6P35712 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX6P35712 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SOX6P35712 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX6P35712 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SOX6P35712 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms