Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DMAP28067 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DMAP28067 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DMAP28067 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DMAP28067 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DMAP28067 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DMAP28067 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DMAP28067 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DMAP28067 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DMAP28067 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DMAP28067 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DMAP28067 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DMAP28067 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DMAP28067 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DMAP28067 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DMAP28067 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DMAP28067 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DMAP28067 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DMAP28067 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DMAP28067 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DMAP28067 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DMAP28067 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DMAP28067 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DMAP28067 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DMAP28067 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HLA-DMAP28067 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DMAP28067 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
HLA-DMAP28067 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DMAP28067 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DMAP28067 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HLA-DMAP28067 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DMAP28067 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HLA-DMAP28067 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-DMAP28067 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HLA-DMAP28067 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DMAP28067 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DMAP28067 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HLA-DMAP28067 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HLA-DMAP28067 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DMAP28067 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HLA-DMAP28067 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DMAP28067 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DMAP28067 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HLA-DMAP28067 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HLA-DMAP28067 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-DMAP28067 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-DMAP28067 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-DMAP28067 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HLA-DMAP28067 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HLA-DMAP28067 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HLA-DMAP28067 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HLA-DMAP28067 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms