Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PLNP26678 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
PLNP26678 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLNP26678 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PLNP26678 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PLNP26678 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PLNP26678 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLNP26678 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PLNP26678 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLNP26678 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PLNP26678 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLNP26678 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLNP26678 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLNP26678 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PLNP26678 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLNP26678 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLNP26678 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLNP26678 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLNP26678 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLNP26678 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLNP26678 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLNP26678 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLNP26678 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PLNP26678 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLNP26678 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PLNP26678 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLNP26678 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLNP26678 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PLNP26678 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLNP26678 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PLNP26678 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PLNP26678 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLNP26678 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PLNP26678 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLNP26678 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLNP26678 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
PLNP26678 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
PLNP26678 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLNP26678 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLNP26678 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PLNP26678 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLNP26678 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLNP26678 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PLNP26678 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLNP26678 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLNP26678 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLNP26678 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLNP26678 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLNP26678 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLNP26678 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PLNP26678 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLNP26678 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PLNP26678 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLNP26678 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLNP26678 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLNP26678 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
PLNP26678 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLNP26678 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
PLNP26678 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLNP26678 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLNP26678 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PLNP26678 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
PLNP26678 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLNP26678 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLNP26678 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLNP26678 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PLNP26678 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PLNP26678 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLNP26678 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PLNP26678 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLNP26678 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLNP26678 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLNP26678 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLNP26678 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PLNP26678 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLNP26678 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PLNP26678 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLNP26678 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PLNP26678 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLNP26678 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLNP26678 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PLNP26678 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLNP26678 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLNP26678 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLNP26678 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PLNP26678 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLNP26678 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLNP26678 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PLNP26678 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLNP26678 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLNP26678 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLNP26678 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PLNP26678 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLNP26678 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLNP26678 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLNP26678 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLNP26678 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PLNP26678 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PLNP26678 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLNP26678 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms