Protein–RNA interactions for Protein: P24004

PEX1, Peroxisomal ATPase PEX1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEX1P24004 SHH4YLR164W 507 nt10.4□□□□□ -0.74
PEX1P24004 SDH5YOL071W 489 nt10.39□□□□□ -0.75
PEX1P24004 CLB6YGR109C 1143 nt10.37□□□□□ -0.75
PEX1P24004 UTH1YKR042W 1098 nt10.34□□□□□ -0.75
PEX1P24004 YFL054CYFL054C 1941 nt10.34□□□□□ -0.75
PEX1P24004 RIB3YDR487C 627 nt10.33□□□□□ -0.76
PEX1P24004 NBP35YGL091C 987 nt10.33□□□□□ -0.76
PEX1P24004 TIR3YIL011W 810 nt10.33□□□□□ -0.76
PEX1P24004 YGR012WYGR012W 1182 nt10.32□□□□□ -0.76
PEX1P24004 FUN14YAL008W 597 nt10.32□□□□□ -0.76
PEX1P24004 HIP1YGR191W 1812 nt10.32□□□□□ -0.76
PEX1P24004 TOM6YOR045W 186 nt10.31□□□□□ -0.76
PEX1P24004 TSC10YBR265W 963 nt10.31□□□□□ -0.76
PEX1P24004 HSP60YLR259C 1719 nt10.3□□□□□ -0.76
PEX1P24004 CCA1YER168C 1641 nt10.29□□□□□ -0.76
PEX1P24004 POM34YLR018C 900 nt10.28□□□□□ -0.76
PEX1P24004 PEX2YJL210W 816 nt10.27□□□□□ -0.77
PEX1P24004 YLR279WYLR279W 390 nt10.27□□□□□ -0.77
PEX1P24004 ADH7YCR105W 1086 nt10.26□□□□□ -0.77
PEX1P24004 YJL195CYJL195C 702 nt10.25□□□□□ -0.77
PEX1P24004 PAU15YIR041W 375 nt10.23□□□□□ -0.77
PEX1P24004 NRT1YOR071C 1797 nt10.23□□□□□ -0.77
PEX1P24004 ADH1YOL086C 1047 nt10.22□□□□□ -0.77
PEX1P24004 YML089CYML089C 369 nt10.2□□□□□ -0.78
PEX1P24004 TIF6YPR016C 738 nt10.2□□□□□ -0.78
PEX1P24004 MSB4YOL112W 1479 nt10.18□□□□□ -0.78
PEX1P24004 PRO1YDR300C 1287 nt10.17□□□□□ -0.78
PEX1P24004 LSC2YGR244C 1284 nt10.17□□□□□ -0.78
PEX1P24004 MET28YIR017C 564 nt10.17□□□□□ -0.78
PEX1P24004 NAR1YNL240C 1476 nt10.17□□□□□ -0.78
PEX1P24004 SWE1YJL187C 2460 nt10.13□□□□□ -0.79
PEX1P24004 STR3YGL184C 1398 nt10.13□□□□□ -0.79
PEX1P24004 YPI1YFR003C 468 nt10.12□□□□□ -0.79
PEX1P24004 YEL008WYEL008W 381 nt10.11□□□□□ -0.79
PEX1P24004 ESS1YJR017C 513 nt10.11□□□□□ -0.79
PEX1P24004 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.1□□□□□ -0.79
PEX1P24004 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.1□□□□□ -0.79
PEX1P24004 GPN2YOR262W 1044 nt10.1□□□□□ -0.79
PEX1P24004 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt10.1□□□□□ -0.79
PEX1P24004 ATG15YCR068W 1563 nt10.09□□□□□ -0.79
PEX1P24004 FIT3YOR383C 615 nt10.08□□□□□ -0.8
PEX1P24004 CPD1YGR247W 720 nt10.07□□□□□ -0.8
PEX1P24004 GND1YHR183W 1470 nt10.06□□□□□ -0.8
PEX1P24004 LOT5YKL183W 921 nt10.05□□□□□ -0.8
PEX1P24004 AQY2YLL052C 450 nt10.05□□□□□ -0.8
PEX1P24004 ARP6YLR085C 1317 nt10.04□□□□□ -0.8
PEX1P24004 DUS1YML080W 1272 nt10.03□□□□□ -0.8
PEX1P24004 AAC1YMR056C 930 nt10.02□□□□□ -0.81
PEX1P24004 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt10□□□□□ -0.81
PEX1P24004 HSL7YBR133C 2484 nt9.99□□□□□ -0.81
PEX1P24004 YCL074WYCL074W 927 nt9.97□□□□□ -0.81
PEX1P24004 GAP1YKR039W 1809 nt9.97□□□□□ -0.81
PEX1P24004 CMP2YML057W 1815 nt9.97□□□□□ -0.81
PEX1P24004 PUP1YOR157C 786 nt9.96□□□□□ -0.82
PEX1P24004 APT2YDR441C 546 nt9.95□□□□□ -0.82
PEX1P24004 ZTA1YBR046C 1005 nt9.92□□□□□ -0.82
PEX1P24004 NAP1YKR048C 1254 nt9.91□□□□□ -0.82
PEX1P24004 SEN2YLR105C 1134 nt9.91□□□□□ -0.82
PEX1P24004 SMM1YNR015W 1155 nt9.9□□□□□ -0.82
PEX1P24004 FCY21YER060W 1587 nt9.89□□□□□ -0.83
PEX1P24004 YAR028WYAR028W 705 nt9.89□□□□□ -0.83
PEX1P24004 DIF1YLR437C 402 nt9.89□□□□□ -0.83
PEX1P24004 ALP1YNL270C 1722 nt9.89□□□□□ -0.83
PEX1P24004 MTG2YHR168W 1557 nt9.88□□□□□ -0.83
PEX1P24004 PLB1YMR008C 1995 nt9.87□□□□□ -0.83
PEX1P24004 PGC1YPL206C 966 nt9.87□□□□□ -0.83
PEX1P24004 RIB2YOL066C 1776 nt9.87□□□□□ -0.83
PEX1P24004 RTN2YDL204W 1182 nt9.86□□□□□ -0.83
PEX1P24004 NME1NME1 340 nt9.86□□□□□ -0.83
PEX1P24004 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.86□□□□□ -0.83
PEX1P24004 YBR232CYBR232C 360 nt9.85□□□□□ -0.83
PEX1P24004 HEL2YDR266C 1920 nt9.85□□□□□ -0.83
PEX1P24004 HXT12YIL170W 1374 nt9.85□□□□□ -0.83
PEX1P24004 AKR2YOR034C 2250 nt9.84□□□□□ -0.83
PEX1P24004 CYT2YKL087C 675 nt9.8□□□□□ -0.84
PEX1P24004 PBP1YGR178C 2169 nt9.8□□□□□ -0.84
PEX1P24004 FUR4YBR021W 1902 nt9.78□□□□□ -0.84
PEX1P24004 PRY1YJL079C 900 nt9.78□□□□□ -0.84
PEX1P24004 ALD4YOR374W 1560 nt9.78□□□□□ -0.84
PEX1P24004 PAU5YFL020C 369 nt9.77□□□□□ -0.85
PEX1P24004 RDN25-1RDN25-1 3396 nt9.77□□□□□ -0.85
PEX1P24004 RDN25-2RDN25-2 3396 nt9.77□□□□□ -0.85
PEX1P24004 UTR1YJR049C 1593 nt9.76□□□□□ -0.85
PEX1P24004 BIO5YNR056C 1686 nt9.75□□□□□ -0.85
PEX1P24004 YJL064WYJL064W 396 nt9.75□□□□□ -0.85
PEX1P24004 STP3YLR375W 1032 nt9.75□□□□□ -0.85
PEX1P24004 PRP4YPR178W 1398 nt9.74□□□□□ -0.85
PEX1P24004 UGA4YDL210W 1716 nt9.73□□□□□ -0.85
PEX1P24004 PAU19YMR325W 375 nt9.72□□□□□ -0.85
PEX1P24004 VRG4YGL225W 1014 nt9.71□□□□□ -0.86
PEX1P24004 CCT5YJR064W 1689 nt9.71□□□□□ -0.86
PEX1P24004 DPS1YLL018C 1674 nt9.68□□□□□ -0.86
PEX1P24004 YJL055WYJL055W 738 nt9.68□□□□□ -0.86
PEX1P24004 YJR114WYJR114W 393 nt9.68□□□□□ -0.86
PEX1P24004 SED1YDR077W 1017 nt9.65□□□□□ -0.86
PEX1P24004 YER190C-AYER190C-A 576 nt9.65□□□□□ -0.86
PEX1P24004 YGR296C-AYGR296C-A 576 nt9.65□□□□□ -0.86
PEX1P24004 YML133W-AYML133W-A 576 nt9.65□□□□□ -0.86
PEX1P24004 YNL339W-AYNL339W-A 576 nt9.65□□□□□ -0.86
PEX1P24004 YPL283W-AYPL283W-A 576 nt9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.9 ms