Protein–RNA interactions for Protein: P20962

PTMS, Parathymosin, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMSP20962 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTMSP20962 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTMSP20962 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTMSP20962 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTMSP20962 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
PTMSP20962 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTMSP20962 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTMSP20962 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTMSP20962 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PTMSP20962 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTMSP20962 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTMSP20962 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTMSP20962 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTMSP20962 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTMSP20962 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTMSP20962 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTMSP20962 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTMSP20962 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTMSP20962 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTMSP20962 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTMSP20962 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PTMSP20962 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PTMSP20962 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
PTMSP20962 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTMSP20962 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTMSP20962 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PTMSP20962 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTMSP20962 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTMSP20962 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTMSP20962 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTMSP20962 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTMSP20962 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTMSP20962 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTMSP20962 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTMSP20962 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTMSP20962 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTMSP20962 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTMSP20962 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTMSP20962 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTMSP20962 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PTMSP20962 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTMSP20962 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PTMSP20962 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PTMSP20962 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PTMSP20962 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PTMSP20962 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTMSP20962 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTMSP20962 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTMSP20962 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PTMSP20962 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PTMSP20962 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
PTMSP20962 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTMSP20962 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PTMSP20962 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PTMSP20962 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTMSP20962 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTMSP20962 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PTMSP20962 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTMSP20962 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTMSP20962 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PTMSP20962 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTMSP20962 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTMSP20962 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PTMSP20962 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PTMSP20962 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PTMSP20962 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTMSP20962 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PTMSP20962 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
PTMSP20962 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTMSP20962 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PTMSP20962 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTMSP20962 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PTMSP20962 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTMSP20962 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PTMSP20962 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTMSP20962 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PTMSP20962 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTMSP20962 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTMSP20962 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PTMSP20962 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTMSP20962 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTMSP20962 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PTMSP20962 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTMSP20962 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PTMSP20962 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PTMSP20962 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PTMSP20962 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTMSP20962 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTMSP20962 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTMSP20962 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PTMSP20962 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTMSP20962 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTMSP20962 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PTMSP20962 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PTMSP20962 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTMSP20962 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PTMSP20962 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PTMSP20962 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTMSP20962 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PTMSP20962 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms