Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL3P19876 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CXCL3P19876 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL3P19876 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL3P19876 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CXCL3P19876 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL3P19876 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CXCL3P19876 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL3P19876 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CXCL3P19876 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL3P19876 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CXCL3P19876 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL3P19876 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CXCL3P19876 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CXCL3P19876 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CXCL3P19876 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CXCL3P19876 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CXCL3P19876 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CXCL3P19876 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL3P19876 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL3P19876 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL3P19876 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL3P19876 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CXCL3P19876 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CXCL3P19876 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL3P19876 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CXCL3P19876 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL3P19876 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CXCL3P19876 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CXCL3P19876 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CXCL3P19876 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL3P19876 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CXCL3P19876 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CXCL3P19876 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL3P19876 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL3P19876 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CXCL3P19876 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL3P19876 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CXCL3P19876 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CXCL3P19876 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL3P19876 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL3P19876 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CXCL3P19876 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL3P19876 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CXCL3P19876 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CXCL3P19876 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL3P19876 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL3P19876 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL3P19876 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CXCL3P19876 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL3P19876 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL3P19876 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CXCL3P19876 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CXCL3P19876 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL3P19876 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CXCL3P19876 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL3P19876 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CXCL3P19876 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CXCL3P19876 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL3P19876 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CXCL3P19876 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL3P19876 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CXCL3P19876 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL3P19876 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL3P19876 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL3P19876 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CXCL3P19876 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL3P19876 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL3P19876 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL3P19876 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL3P19876 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CXCL3P19876 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CXCL3P19876 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCL3P19876 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CXCL3P19876 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CXCL3P19876 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms