Protein–RNA interactions for Protein: P14314

PRKCSH, Glucosidase 2 subunit beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCSHP14314 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRKCSHP14314 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PRKCSHP14314 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PRKCSHP14314 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PRKCSHP14314 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PRKCSHP14314 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRKCSHP14314 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRKCSHP14314 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PRKCSHP14314 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PRKCSHP14314 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRKCSHP14314 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRKCSHP14314 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PRKCSHP14314 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
PRKCSHP14314 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PRKCSHP14314 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PRKCSHP14314 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PRKCSHP14314 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PRKCSHP14314 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PRKCSHP14314 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PRKCSHP14314 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PRKCSHP14314 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRKCSHP14314 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRKCSHP14314 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRKCSHP14314 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRKCSHP14314 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRKCSHP14314 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRKCSHP14314 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRKCSHP14314 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRKCSHP14314 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRKCSHP14314 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRKCSHP14314 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PRKCSHP14314 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
PRKCSHP14314 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PRKCSHP14314 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PRKCSHP14314 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRKCSHP14314 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRKCSHP14314 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRKCSHP14314 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRKCSHP14314 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRKCSHP14314 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRKCSHP14314 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRKCSHP14314 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRKCSHP14314 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PRKCSHP14314 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRKCSHP14314 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRKCSHP14314 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRKCSHP14314 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRKCSHP14314 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRKCSHP14314 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRKCSHP14314 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRKCSHP14314 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRKCSHP14314 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRKCSHP14314 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRKCSHP14314 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRKCSHP14314 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRKCSHP14314 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRKCSHP14314 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRKCSHP14314 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRKCSHP14314 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRKCSHP14314 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRKCSHP14314 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRKCSHP14314 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRKCSHP14314 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRKCSHP14314 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRKCSHP14314 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRKCSHP14314 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRKCSHP14314 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRKCSHP14314 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRKCSHP14314 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRKCSHP14314 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRKCSHP14314 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PRKCSHP14314 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PRKCSHP14314 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PRKCSHP14314 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PRKCSHP14314 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRKCSHP14314 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRKCSHP14314 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRKCSHP14314 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PRKCSHP14314 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PRKCSHP14314 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PRKCSHP14314 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRKCSHP14314 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRKCSHP14314 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PRKCSHP14314 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRKCSHP14314 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRKCSHP14314 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PRKCSHP14314 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRKCSHP14314 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRKCSHP14314 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PRKCSHP14314 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRKCSHP14314 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PRKCSHP14314 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PRKCSHP14314 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PRKCSHP14314 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRKCSHP14314 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRKCSHP14314 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PRKCSHP14314 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRKCSHP14314 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRKCSHP14314 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PRKCSHP14314 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms