Protein–RNA interactions for Protein: P10828

THRB, Thyroid hormone receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRBP10828 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
THRBP10828 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
THRBP10828 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
THRBP10828 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
THRBP10828 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
THRBP10828 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
THRBP10828 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
THRBP10828 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
THRBP10828 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
THRBP10828 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
THRBP10828 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
THRBP10828 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
THRBP10828 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
THRBP10828 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRBP10828 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
THRBP10828 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
THRBP10828 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRBP10828 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
THRBP10828 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
THRBP10828 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRBP10828 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRBP10828 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
THRBP10828 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
THRBP10828 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRBP10828 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
THRBP10828 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRBP10828 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRBP10828 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
THRBP10828 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRBP10828 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
THRBP10828 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
THRBP10828 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
THRBP10828 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THRBP10828 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
THRBP10828 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THRBP10828 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
THRBP10828 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
THRBP10828 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRBP10828 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRBP10828 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
THRBP10828 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
THRBP10828 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRBP10828 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
THRBP10828 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRBP10828 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
THRBP10828 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
THRBP10828 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRBP10828 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
THRBP10828 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRBP10828 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRBP10828 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRBP10828 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRBP10828 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
THRBP10828 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRBP10828 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRBP10828 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRBP10828 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRBP10828 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
THRBP10828 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
THRBP10828 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRBP10828 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRBP10828 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
THRBP10828 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRBP10828 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
THRBP10828 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
THRBP10828 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
THRBP10828 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRBP10828 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
THRBP10828 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRBP10828 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
THRBP10828 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRBP10828 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THRBP10828 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THRBP10828 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THRBP10828 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRBP10828 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
THRBP10828 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
THRBP10828 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THRBP10828 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRBP10828 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRBP10828 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRBP10828 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THRBP10828 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRBP10828 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THRBP10828 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THRBP10828 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRBP10828 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
THRBP10828 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THRBP10828 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRBP10828 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRBP10828 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRBP10828 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
THRBP10828 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRBP10828 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THRBP10828 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRBP10828 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRBP10828 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRBP10828 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THRBP10828 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
THRBP10828 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms