Protein–RNA interactions for Protein: P09132

SRP19, Signal recognition particle 19 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19P09132 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP19P09132 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP19P09132 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP19P09132 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRP19P09132 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP19P09132 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP19P09132 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP19P09132 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP19P09132 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP19P09132 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP19P09132 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP19P09132 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP19P09132 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP19P09132 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP19P09132 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP19P09132 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP19P09132 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP19P09132 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP19P09132 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP19P09132 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SRP19P09132 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRP19P09132 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRP19P09132 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRP19P09132 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRP19P09132 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRP19P09132 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRP19P09132 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRP19P09132 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRP19P09132 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRP19P09132 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRP19P09132 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SRP19P09132 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRP19P09132 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRP19P09132 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SRP19P09132 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SRP19P09132 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRP19P09132 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SRP19P09132 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SRP19P09132 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRP19P09132 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRP19P09132 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRP19P09132 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SRP19P09132 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRP19P09132 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SRP19P09132 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SRP19P09132 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRP19P09132 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRP19P09132 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRP19P09132 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRP19P09132 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SRP19P09132 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRP19P09132 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SRP19P09132 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRP19P09132 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SRP19P09132 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRP19P09132 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SRP19P09132 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRP19P09132 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRP19P09132 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SRP19P09132 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRP19P09132 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SRP19P09132 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRP19P09132 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRP19P09132 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SRP19P09132 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SRP19P09132 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRP19P09132 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRP19P09132 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRP19P09132 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRP19P09132 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SRP19P09132 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SRP19P09132 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRP19P09132 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRP19P09132 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRP19P09132 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SRP19P09132 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRP19P09132 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SRP19P09132 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SRP19P09132 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRP19P09132 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRP19P09132 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRP19P09132 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRP19P09132 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRP19P09132 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SRP19P09132 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRP19P09132 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SRP19P09132 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRP19P09132 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRP19P09132 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SRP19P09132 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRP19P09132 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SRP19P09132 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRP19P09132 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRP19P09132 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRP19P09132 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRP19P09132 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRP19P09132 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRP19P09132 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRP19P09132 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SRP19P09132 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms