Protein–RNA interactions for Protein: P06493

CDK1, Cyclin-dependent kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK1P06493 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK1P06493 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDK1P06493 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK1P06493 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDK1P06493 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDK1P06493 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDK1P06493 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDK1P06493 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDK1P06493 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK1P06493 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CDK1P06493 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK1P06493 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK1P06493 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CDK1P06493 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK1P06493 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CDK1P06493 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK1P06493 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK1P06493 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK1P06493 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK1P06493 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK1P06493 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK1P06493 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK1P06493 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK1P06493 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK1P06493 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK1P06493 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK1P06493 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK1P06493 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK1P06493 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK1P06493 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK1P06493 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK1P06493 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK1P06493 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK1P06493 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK1P06493 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK1P06493 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CDK1P06493 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK1P06493 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK1P06493 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK1P06493 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK1P06493 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK1P06493 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK1P06493 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK1P06493 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK1P06493 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK1P06493 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK1P06493 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK1P06493 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK1P06493 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK1P06493 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK1P06493 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK1P06493 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK1P06493 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK1P06493 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK1P06493 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK1P06493 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK1P06493 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK1P06493 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK1P06493 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK1P06493 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK1P06493 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK1P06493 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK1P06493 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK1P06493 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK1P06493 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK1P06493 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK1P06493 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK1P06493 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK1P06493 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK1P06493 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK1P06493 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK1P06493 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK1P06493 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK1P06493 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK1P06493 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK1P06493 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK1P06493 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK1P06493 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK1P06493 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK1P06493 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK1P06493 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK1P06493 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK1P06493 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK1P06493 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK1P06493 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK1P06493 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK1P06493 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK1P06493 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK1P06493 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK1P06493 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK1P06493 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK1P06493 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK1P06493 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK1P06493 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK1P06493 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK1P06493 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK1P06493 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK1P06493 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK1P06493 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CDK1P06493 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms