Protein–RNA interactions for Protein: P02100

HBE1, Hemoglobin subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBE1P02100 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HBE1P02100 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HBE1P02100 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HBE1P02100 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HBE1P02100 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HBE1P02100 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HBE1P02100 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HBE1P02100 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HBE1P02100 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HBE1P02100 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
HBE1P02100 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HBE1P02100 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HBE1P02100 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HBE1P02100 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HBE1P02100 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HBE1P02100 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HBE1P02100 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HBE1P02100 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HBE1P02100 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HBE1P02100 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HBE1P02100 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HBE1P02100 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HBE1P02100 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HBE1P02100 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HBE1P02100 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HBE1P02100 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HBE1P02100 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HBE1P02100 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HBE1P02100 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HBE1P02100 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HBE1P02100 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HBE1P02100 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HBE1P02100 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBE1P02100 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HBE1P02100 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HBE1P02100 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HBE1P02100 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HBE1P02100 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HBE1P02100 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HBE1P02100 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HBE1P02100 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HBE1P02100 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HBE1P02100 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HBE1P02100 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HBE1P02100 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HBE1P02100 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HBE1P02100 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HBE1P02100 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HBE1P02100 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HBE1P02100 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HBE1P02100 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HBE1P02100 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HBE1P02100 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HBE1P02100 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HBE1P02100 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HBE1P02100 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HBE1P02100 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HBE1P02100 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HBE1P02100 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HBE1P02100 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HBE1P02100 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HBE1P02100 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HBE1P02100 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HBE1P02100 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HBE1P02100 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HBE1P02100 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HBE1P02100 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HBE1P02100 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HBE1P02100 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HBE1P02100 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HBE1P02100 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HBE1P02100 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HBE1P02100 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HBE1P02100 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HBE1P02100 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HBE1P02100 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
HBE1P02100 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HBE1P02100 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HBE1P02100 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HBE1P02100 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBE1P02100 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBE1P02100 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBE1P02100 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
HBE1P02100 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HBE1P02100 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HBE1P02100 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBE1P02100 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBE1P02100 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBE1P02100 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBE1P02100 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBE1P02100 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HBE1P02100 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBE1P02100 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBE1P02100 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBE1P02100 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBE1P02100 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBE1P02100 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBE1P02100 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HBE1P02100 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HBE1P02100 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms