Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX6O95475 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX6O95475 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SIX6O95475 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SIX6O95475 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX6O95475 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SIX6O95475 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SIX6O95475 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SIX6O95475 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SIX6O95475 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SIX6O95475 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SIX6O95475 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX6O95475 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX6O95475 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SIX6O95475 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX6O95475 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX6O95475 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SIX6O95475 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX6O95475 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX6O95475 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SIX6O95475 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SIX6O95475 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX6O95475 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SIX6O95475 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SIX6O95475 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX6O95475 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SIX6O95475 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX6O95475 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SIX6O95475 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX6O95475 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX6O95475 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX6O95475 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SIX6O95475 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SIX6O95475 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX6O95475 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX6O95475 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX6O95475 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SIX6O95475 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX6O95475 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SIX6O95475 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SIX6O95475 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX6O95475 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SIX6O95475 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX6O95475 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SIX6O95475 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX6O95475 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SIX6O95475 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SIX6O95475 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX6O95475 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX6O95475 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX6O95475 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SIX6O95475 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX6O95475 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX6O95475 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX6O95475 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SIX6O95475 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX6O95475 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX6O95475 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX6O95475 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX6O95475 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SIX6O95475 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SIX6O95475 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX6O95475 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX6O95475 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SIX6O95475 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX6O95475 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX6O95475 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX6O95475 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SIX6O95475 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX6O95475 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX6O95475 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX6O95475 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX6O95475 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX6O95475 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SIX6O95475 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX6O95475 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX6O95475 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SIX6O95475 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX6O95475 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX6O95475 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX6O95475 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SIX6O95475 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SIX6O95475 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX6O95475 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX6O95475 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX6O95475 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX6O95475 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX6O95475 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX6O95475 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX6O95475 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX6O95475 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SIX6O95475 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX6O95475 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX6O95475 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SIX6O95475 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX6O95475 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SIX6O95475 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX6O95475 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX6O95475 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SIX6O95475 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms