Protein–RNA interactions for Protein: O95379

TNFAIP8, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8O95379 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP8O95379 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP8O95379 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TNFAIP8O95379 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP8O95379 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TNFAIP8O95379 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TNFAIP8O95379 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP8O95379 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TNFAIP8O95379 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP8O95379 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TNFAIP8O95379 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TNFAIP8O95379 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TNFAIP8O95379 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
TNFAIP8O95379 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TNFAIP8O95379 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TNFAIP8O95379 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms