Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
TRAK2O60296 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRAK2O60296 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRAK2O60296 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRAK2O60296 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
TRAK2O60296 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
TRAK2O60296 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
TRAK2O60296 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
TRAK2O60296 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
TRAK2O60296 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAK2O60296 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAK2O60296 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAK2O60296 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
TRAK2O60296 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
TRAK2O60296 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAK2O60296 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAK2O60296 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
TRAK2O60296 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TRAK2O60296 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
TRAK2O60296 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRAK2O60296 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
TRAK2O60296 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
TRAK2O60296 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
TRAK2O60296 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
TRAK2O60296 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
TRAK2O60296 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAK2O60296 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
TRAK2O60296 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAK2O60296 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAK2O60296 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAK2O60296 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAK2O60296 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
TRAK2O60296 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAK2O60296 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
TRAK2O60296 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TRAK2O60296 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAK2O60296 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAK2O60296 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TRAK2O60296 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
TRAK2O60296 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TRAK2O60296 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TRAK2O60296 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAK2O60296 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TRAK2O60296 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAK2O60296 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TRAK2O60296 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TRAK2O60296 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAK2O60296 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TRAK2O60296 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAK2O60296 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAK2O60296 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TRAK2O60296 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TRAK2O60296 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TRAK2O60296 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAK2O60296 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAK2O60296 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TRAK2O60296 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TRAK2O60296 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRAK2O60296 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRAK2O60296 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
TRAK2O60296 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TRAK2O60296 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAK2O60296 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TRAK2O60296 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRAK2O60296 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRAK2O60296 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TRAK2O60296 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TRAK2O60296 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRAK2O60296 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TRAK2O60296 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TRAK2O60296 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TRAK2O60296 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAK2O60296 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAK2O60296 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAK2O60296 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TRAK2O60296 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAK2O60296 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAK2O60296 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TRAK2O60296 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAK2O60296 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAK2O60296 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAK2O60296 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TRAK2O60296 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
TRAK2O60296 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAK2O60296 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
TRAK2O60296 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TRAK2O60296 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRAK2O60296 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
TRAK2O60296 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAK2O60296 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
TRAK2O60296 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRAK2O60296 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRAK2O60296 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRAK2O60296 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TRAK2O60296 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAK2O60296 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAK2O60296 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TRAK2O60296 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.31■■■□□ 2.6
TRAK2O60296 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TRAK2O60296 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms