Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RRP9O43818 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RRP9O43818 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP9O43818 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RRP9O43818 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RRP9O43818 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP9O43818 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RRP9O43818 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RRP9O43818 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP9O43818 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RRP9O43818 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP9O43818 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP9O43818 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RRP9O43818 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RRP9O43818 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RRP9O43818 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRP9O43818 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RRP9O43818 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RRP9O43818 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RRP9O43818 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RRP9O43818 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRP9O43818 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
RRP9O43818 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RRP9O43818 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RRP9O43818 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP9O43818 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RRP9O43818 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP9O43818 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
RRP9O43818 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP9O43818 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RRP9O43818 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP9O43818 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP9O43818 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RRP9O43818 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP9O43818 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP9O43818 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RRP9O43818 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RRP9O43818 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RRP9O43818 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP9O43818 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP9O43818 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RRP9O43818 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RRP9O43818 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RRP9O43818 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP9O43818 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP9O43818 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RRP9O43818 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RRP9O43818 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP9O43818 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP9O43818 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RRP9O43818 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RRP9O43818 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP9O43818 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP9O43818 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
RRP9O43818 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RRP9O43818 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RRP9O43818 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP9O43818 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
RRP9O43818 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP9O43818 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP9O43818 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
RRP9O43818 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP9O43818 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RRP9O43818 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP9O43818 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP9O43818 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP9O43818 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RRP9O43818 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRP9O43818 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
RRP9O43818 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP9O43818 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RRP9O43818 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRP9O43818 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRP9O43818 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
RRP9O43818 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
RRP9O43818 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RRP9O43818 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRP9O43818 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRP9O43818 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RRP9O43818 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RRP9O43818 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP9O43818 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
RRP9O43818 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RRP9O43818 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
RRP9O43818 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP9O43818 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP9O43818 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP9O43818 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
RRP9O43818 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP9O43818 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP9O43818 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP9O43818 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP9O43818 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
RRP9O43818 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP9O43818 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP9O43818 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP9O43818 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP9O43818 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP9O43818 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RRP9O43818 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms