Protein–RNA interactions for Protein: A8MVA2

KRTAP9-6, Keratin-associated protein 9-6, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-6A8MVA2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.03□□□□□ -0.96
KRTAP9-6A8MVA2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
KRTAP9-6A8MVA2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
KRTAP9-6A8MVA2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
KRTAP9-6A8MVA2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms