Protein–RNA interactions for Protein: A6NGJ6

TRIM64, Tripartite motif-containing protein 64, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM64A6NGJ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM64A6NGJ6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM64A6NGJ6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TRIM64A6NGJ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM64A6NGJ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TRIM64A6NGJ6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TRIM64A6NGJ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM64A6NGJ6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM64A6NGJ6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM64A6NGJ6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TRIM64A6NGJ6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM64A6NGJ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TRIM64A6NGJ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM64A6NGJ6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TRIM64A6NGJ6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM64A6NGJ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM64A6NGJ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TRIM64A6NGJ6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TRIM64A6NGJ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM64A6NGJ6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM64A6NGJ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM64A6NGJ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM64A6NGJ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM64A6NGJ6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM64A6NGJ6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM64A6NGJ6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM64A6NGJ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM64A6NGJ6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM64A6NGJ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM64A6NGJ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM64A6NGJ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM64A6NGJ6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM64A6NGJ6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM64A6NGJ6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM64A6NGJ6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM64A6NGJ6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM64A6NGJ6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM64A6NGJ6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM64A6NGJ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM64A6NGJ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM64A6NGJ6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM64A6NGJ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM64A6NGJ6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM64A6NGJ6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM64A6NGJ6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM64A6NGJ6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM64A6NGJ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM64A6NGJ6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM64A6NGJ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM64A6NGJ6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM64A6NGJ6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM64A6NGJ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM64A6NGJ6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM64A6NGJ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM64A6NGJ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM64A6NGJ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM64A6NGJ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM64A6NGJ6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM64A6NGJ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM64A6NGJ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.5 ms