Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CFAP73A6NFT4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP73A6NFT4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP73A6NFT4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CFAP73A6NFT4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP73A6NFT4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CFAP73A6NFT4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CFAP73A6NFT4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP73A6NFT4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CFAP73A6NFT4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP73A6NFT4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP73A6NFT4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CFAP73A6NFT4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP73A6NFT4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP73A6NFT4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP73A6NFT4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP73A6NFT4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CFAP73A6NFT4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CFAP73A6NFT4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP73A6NFT4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP73A6NFT4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CFAP73A6NFT4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP73A6NFT4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CFAP73A6NFT4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP73A6NFT4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP73A6NFT4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CFAP73A6NFT4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP73A6NFT4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CFAP73A6NFT4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CFAP73A6NFT4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CFAP73A6NFT4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP73A6NFT4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CFAP73A6NFT4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CFAP73A6NFT4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP73A6NFT4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CFAP73A6NFT4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP73A6NFT4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP73A6NFT4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP73A6NFT4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CFAP73A6NFT4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP73A6NFT4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CFAP73A6NFT4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CFAP73A6NFT4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP73A6NFT4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CFAP73A6NFT4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP73A6NFT4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CFAP73A6NFT4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP73A6NFT4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CFAP73A6NFT4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP73A6NFT4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP73A6NFT4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CFAP73A6NFT4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP73A6NFT4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP73A6NFT4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CFAP73A6NFT4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CFAP73A6NFT4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP73A6NFT4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CFAP73A6NFT4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CFAP73A6NFT4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP73A6NFT4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CFAP73A6NFT4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CFAP73A6NFT4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP73A6NFT4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP73A6NFT4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CFAP73A6NFT4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP73A6NFT4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CFAP73A6NFT4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CFAP73A6NFT4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CFAP73A6NFT4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP73A6NFT4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP73A6NFT4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP73A6NFT4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CFAP73A6NFT4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP73A6NFT4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CFAP73A6NFT4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CFAP73A6NFT4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CFAP73A6NFT4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CFAP73A6NFT4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CFAP73A6NFT4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms