Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LINC02105-202ENST00000511953 870 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SLC25A51P3-201ENST00000521814 889 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LINC02414-201ENST00000537280 494 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ATP2C1-204ENST00000428331 4795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 GLE1-202ENST00000372770 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 MAGEB17-201ENST00000400003 1379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LINC00910-201ENST00000341011 2303 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LINC01588-208ENST00000554129 2301 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ZNF197-202ENST00000344387 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ALK-207ENST00000642122 2513 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 NAGA-203ENST00000403363 1856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PCAT1-202ENST00000561978 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CDC42BPA-205ENST00000366769 10855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ERC2-IT1-201ENST00000629461 2177 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CES5A-206ENST00000521992 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 MYHAS-201ENST00000587182 2274 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CCDC126-201ENST00000307471 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 BCL2L13-215ENST00000611738 4817 ntTSL 4 BASIC11.1□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 GRM3-201ENST00000361669 4268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 FN1-206ENST00000359671 8524 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 BNIPL-203ENST00000368931 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 BCORL1-201ENST00000218147 6860 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 FAM133B-203ENST00000438306 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ASB11-202ENST00000380470 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 HHAT-201ENST00000261458 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 WDPCP-201ENST00000272321 3392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CXCR1-201ENST00000295683 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 LINC00327-201ENST00000443778 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 JADE1-213ENST00000610919 5644 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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LSAMPQ13449 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 GOLGA8EP-202ENST00000620011 5241 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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LSAMPQ13449 DR1-202ENST00000370272 10148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SULT1A4-201ENST00000360423 1390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 KLHL1-201ENST00000377844 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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LSAMPQ13449 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AL158151.2-201ENST00000434250 241 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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LSAMPQ13449 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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LSAMPQ13449 AC024257.3-201ENST00000595310 3645 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ATP1A3-207ENST00000543770 3427 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 KPNA3-201ENST00000261667 4474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 WDR47-203ENST00000369962 4199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TP53-213ENST00000510385 2404 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 TP53-223ENST00000618944 2404 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 P2RX6-202ENST00000413302 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 RNF138-202ENST00000261593 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 BTF3L4-201ENST00000313334 4703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 ATP2B3-203ENST00000359149 4234 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 BCL2L13-201ENST00000317582 2992 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 HNRNPR-203ENST00000374616 2691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 AL133464.1-205ENST00000634595 1535 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 KPRP-201ENST00000606109 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 MPP2-218ENST00000536246 4351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 CD226-206ENST00000581982 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 YAF2-203ENST00000534854 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
LSAMPQ13449 SNX29P2-202ENST00000507381 1857 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
LSAMPQ13449 ZBTB14-208ENST00000615385 3350 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
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