Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TRIM49B-201ENST00000332682 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 RAP1GAP-201ENST00000290101 3584 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PTGR2-201ENST00000267568 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC017083.4-201ENST00000406334 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 SCNN1B-207ENST00000568085 1825 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ERBB2-203ENST00000445658 3238 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 YWHAB-202ENST00000372839 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 KNSTRN-203ENST00000448395 1464 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 UBE2L3-201ENST00000342192 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ERCC6L2-201ENST00000288985 4564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PDZD4-209ENST00000544474 3418 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CEP63-216ENST00000620544 1601 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 KLF6-206ENST00000497571 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ZNF792-202ENST00000605484 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PRKAG1-205ENST00000547306 1531 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ST6GAL1-215ENST00000457772 3947 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CDX2-201ENST00000381020 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ACSBG1-214ENST00000560817 2462 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 TUBD1-205ENST00000394239 1680 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 TSPAN16-201ENST00000316737 1040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ATP5G2-202ENST00000394349 878 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 POLR3DP1-201ENST00000398689 1176 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CD79A-202ENST00000444740 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 IP6K2-222ENST00000450045 689 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC005220.1-201ENST00000450473 884 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC010280.2-201ENST00000507733 410 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ELMOD2-206ENST00000511887 751 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 LINC02105-202ENST00000511953 870 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC112694.1-202ENST00000540985 943 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC116553.1-201ENST00000561752 397 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CNDP2-228ENST00000584768 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AFMID-205ENST00000586731 550 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AFMID-210ENST00000589256 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 LINC01198-206ENST00000595532 1125 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ZNF155-202ENST00000407951 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 DGCR11-201ENST00000609958 2214 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AFAP1L1-201ENST00000296721 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PAX6-249ENST00000639034 1597 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ARSG-202ENST00000452479 1733 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CDKL1-203ENST00000395834 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 TCTN3-204ENST00000430368 1778 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 GUCY1A3-213ENST00000621234 1788 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CRNN-201ENST00000271835 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC015712.2-201ENST00000560351 3688 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 SYNGAP1-207ENST00000628646 4264 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 IMPDH1P11-201ENST00000567885 1504 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 EGR3-201ENST00000317216 4336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AAGAB-207ENST00000561452 2251 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 NIP7-201ENST00000254940 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CTBP1-AS2-202ENST00000505364 2423 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 GTPBP4-202ENST00000360803 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 SNX16-203ENST00000396330 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 SPACA7-201ENST00000283550 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 TBC1D21-201ENST00000300504 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 ATP13A2-201ENST00000326735 3840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 MBD3L2-201ENST00000381393 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 OR2A14-201ENST00000408899 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CACNA1G-207ENST00000429973 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 SLC25A39P1-201ENST00000444461 1065 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC009305.1-201ENST00000449780 368 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CACNA1G-217ENST00000507336 7116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PSCA-204ENST00000513264 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 HOXC-AS2-201ENST00000513533 504 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC090821.1-201ENST00000517380 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AL136298.3-201ENST00000556746 445 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 MT1G-204ENST00000569500 305 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC003965.2-201ENST00000577140 265 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC023389.1-201ENST00000577846 576 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 TBC1D3P5-203ENST00000586223 3083 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PIGN-214ENST00000589720 1853 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 MEG8_2.1-201ENST00000610604 122 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC012313.9-201ENST00000619318 633 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC007274.3-201ENST00000619838 385 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 AC027281.2-201ENST00000623856 713 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CAMK1G-201ENST00000009105 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
PTPRJQ12913 CAGE1-201ENST00000296742 2821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms