Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC015849.1-201ENST00000605548 662 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC137834.2-201ENST00000617433 701 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 SPATA6-203ENST00000371847 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CISD1-201ENST00000333926 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
LSAMPQ13449 UGT1A7-201ENST00000373426 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SPTBN2-211ENST00000617502 3498 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LACC1-203ENST00000441843 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ITGA10-201ENST00000369304 5269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 UST-201ENST00000367463 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MYO10-210ENST00000513610 8038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ZIC4-202ENST00000425731 3979 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CXXC4-AS1-201ENST00000500179 2968 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 URM1-204ENST00000452446 2944 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DIAPH3-205ENST00000400324 4804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SPOP-205ENST00000503676 1932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 NFIB-206ENST00000397575 2869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PUM2-203ENST00000361078 6251 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CAPN3-205ENST00000357568 2669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DMD-209ENST00000378702 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TRIM29-201ENST00000341846 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 STRN-201ENST00000263918 8168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TNFAIP3-211ENST00000621150 1613 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC010182.1-201ENST00000548943 2434 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 BMPR1B-208ENST00000515059 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DCANP1-201ENST00000503143 3135 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PCBP2-203ENST00000437231 3026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 DCT-201ENST00000377028 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 KLKB1-207ENST00000513864 2175 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ECI2-202ENST00000380118 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ZNF250-202ENST00000417550 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CDC25C-202ENST00000348983 1951 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 LCE2D-201ENST00000368784 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AK2-206ENST00000480134 811 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 PIK3R3-204ENST00000423209 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ELMO2-201ENST00000290246 3669 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 APLNR-202ENST00000606794 3609 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 IFIT5-201ENST00000371795 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 SMARCA2-258ENST00000637103 5657 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC020904.2-201ENST00000621646 1669 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ZNF135-204ENST00000506786 3349 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 AC004156.1-201ENST00000591866 3319 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MAP2K4-202ENST00000415385 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 FCHO2-202ENST00000430046 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ACSBG2-210ENST00000591403 2690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CELF5-203ENST00000541430 4268 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 VTA1-203ENST00000452973 3177 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CATSPER1-201ENST00000312106 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 RGS3-203ENST00000343817 3689 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 NREP-205ENST00000446294 2065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MGAT5B-203ENST00000428789 4053 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 NECTIN4-201ENST00000368012 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 OXNAD1-209ENST00000627468 3983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 GP2-202ENST00000341642 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ITGAD-201ENST00000389202 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 ABL2-204ENST00000502732 12144 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MED27-201ENST00000292035 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 GPR61-207ENST00000618721 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 CHEK1-204ENST00000438015 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
LSAMPQ13449 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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