Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 TFAM-201ENST00000373895 973 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 IGLV3-21-201ENST00000390308 602 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AP003306.2-201ENST00000400902 485 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC005587.1-201ENST00000401879 592 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AL354714.2-201ENST00000425270 1097 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 LINC01693-202ENST00000430123 357 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC093106.1-201ENST00000437271 352 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 INO80C-203ENST00000441607 904 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AL354676.1-201ENST00000458047 368 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 FP325317.1-201ENST00000539936 1042 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 DNM1P50-201ENST00000565767 508 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC002558.2-201ENST00000572193 673 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC092471.1-202ENST00000637160 999 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC092329.4-208ENST00000640354 562 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CD74-201ENST00000009530 981 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CDNF-202ENST00000378442 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MTFR1L-210ENST00000474295 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SCAMP1-207ENST00000621999 4509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 COMMD10-207ENST00000632434 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 NEK4-201ENST00000233027 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 FLJ37035-202ENST00000423178 2600 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 GADL1-201ENST00000282538 3759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC008966.1-201ENST00000502171 2367 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 C10orf128-203ENST00000374153 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 ST5-258ENST00000534278 1352 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 RTEL1-211ENST00000508582 4273 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 ZNF502-203ENST00000436624 2314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 KLK7-202ENST00000391807 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 HYPK-203ENST00000458412 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 TYR-201ENST00000263321 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 DLC1-210ENST00000512044 3758 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 PCYT1A-206ENST00000431016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 FKBP9P1-201ENST00000441699 1491 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CD300LB-201ENST00000314401 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 HSD17B3-201ENST00000375262 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 IFITM2-202ENST00000399817 659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MIR874-201ENST00000401190 78 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 TGIF2P1-201ENST00000435390 685 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC109779.1-202ENST00000439810 579 ntTSL 4 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SLC48A1-202ENST00000442892 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 HAX1-204ENST00000457918 914 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 RN7SL225P-201ENST00000464648 298 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 RN7SL304P-201ENST00000488028 301 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 RCC2P4-201ENST00000513160 1042 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AKR1B1P3-201ENST00000525311 588 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 KIAA1191-211ENST00000533553 560 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC073655.1-201ENST00000550111 493 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC106782.3-201ENST00000563429 258 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 TTC39A-AS1-201ENST00000564479 812 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC006236.1-201ENST00000576249 797 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 PHACTR3-203ENST00000361300 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 A2M-AS1-201ENST00000499762 2192 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 PACRG-AS1-201ENST00000626335 2192 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 FAM47A-202ENST00000613251 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MID1IP1-204ENST00000614558 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 ANXA8-205ENST00000585281 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CCDC114-201ENST00000315396 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SPRED2-201ENST00000356388 4097 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 LINC01149-202ENST00000430364 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 UBXN4-201ENST00000272638 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 POLR3E-201ENST00000299853 3697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 LINC01551-201ENST00000399387 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CDH3-202ENST00000429102 3611 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SEC31A-202ENST00000311785 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 ASB9-202ENST00000380485 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 NOP2-201ENST00000322166 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 CAST-233ENST00000510756 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 MS4A15-202ENST00000405633 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 GMPR2-202ENST00000355299 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 BARD1-214ENST00000620057 1456 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AC093690.1-201ENST00000418963 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PTPRJQ12913 AL132656.4-201ENST00000623504 2122 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms