Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQK5 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQK5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQK5 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQK5 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
U3KQK5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
U3KQK5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
U3KQK5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQK5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQK5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQK5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQK5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQK5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQK5 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQK5 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQK5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQK5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQK5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQK5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQK5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
U3KQK5 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
U3KQK5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
U3KQK5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
U3KQK5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms