Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
CAMTA1Q9Y6Y1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CAMTA1Q9Y6Y1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CAMTA1Q9Y6Y1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms