Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PARP3Q9Y6F1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PARP3Q9Y6F1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PARP3Q9Y6F1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms