Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLXND1Q9Y4D7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLXND1Q9Y4D7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLXND1Q9Y4D7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLXND1Q9Y4D7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PLXND1Q9Y4D7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXND1Q9Y4D7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms