Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SH3BP1Q9Y3L3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms