Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UTP11Q9Y3A2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UTP11Q9Y3A2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms